More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5004 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  37.79 
 
 		 911 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  38.71 
 
 		 968 aa  663    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  36.88 
 
 		 916 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  36.36 
 
 		 911 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  57.21 
 
 		 1113 aa  1299    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  51.87 
 
 		 1116 aa  1135    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  39.17 
 
 		 858 aa  653    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  50.1 
 
 		 1024 aa  974    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  37.31 
 
 		 911 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  49.75 
 
 		 1031 aa  967    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  58.73 
 
 		 1118 aa  1318    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  37.46 
 
 		 915 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  35.98 
 
 		 934 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  49.08 
 
 		 1024 aa  986    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  50.2 
 
 		 1017 aa  973    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  47.66 
 
 		 1136 aa  1035    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  37.03 
 
 		 910 aa  637    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  43.21 
 
 		 1004 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  71.29 
 
 		 1120 aa  1676    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  43.09 
 
 		 1117 aa  806    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 1114 aa  2289    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  57.05 
 
 		 1118 aa  1271    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  70.66 
 
 		 1117 aa  1636    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  49.66 
 
 		 1027 aa  954    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  36.63 
 
 		 903 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  56.8 
 
 		 1130 aa  1278    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  57.39 
 
 		 1114 aa  1296    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  49.95 
 
 		 1029 aa  981    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  49.62 
 
 		 1022 aa  963    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  36.36 
 
 		 939 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  63.71 
 
 		 1102 aa  1367    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  37.39 
 
 		 913 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  36.05 
 
 		 913 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  37.03 
 
 		 912 aa  633  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  38.1 
 
 		 848 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  37.57 
 
 		 867 aa  631  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  37.58 
 
 		 939 aa  631  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  36.17 
 
 		 916 aa  632  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  36.11 
 
 		 913 aa  629  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  38.01 
 
 		 897 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  40.15 
 
 		 896 aa  622  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  37.06 
 
 		 897 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  37.21 
 
 		 914 aa  612  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  37.14 
 
 		 1024 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  35.02 
 
 		 916 aa  611  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  37.25 
 
 		 1010 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  37.02 
 
 		 910 aa  605  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  35.23 
 
 		 907 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  36.42 
 
 		 904 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  36.42 
 
 		 904 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  36.42 
 
 		 904 aa  596  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  36.11 
 
 		 904 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  36.72 
 
 		 909 aa  592  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  35.92 
 
 		 909 aa  588  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  34.54 
 
 		 917 aa  585  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  35.99 
 
 		 915 aa  572  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  33.59 
 
 		 921 aa  572  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  35.17 
 
 		 992 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  39.61 
 
 		 970 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  48.69 
 
 		 859 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  44.84 
 
 		 830 aa  488  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  43.12 
 
 		 896 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  44.8 
 
 		 866 aa  480  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  46.92 
 
 		 899 aa  476  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  43.31 
 
 		 864 aa  476  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  42.93 
 
 		 834 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  43.68 
 
 		 840 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  42.79 
 
 		 845 aa  475  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  48.33 
 
 		 840 aa  476  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  46.99 
 
 		 796 aa  475  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  46.4 
 
 		 897 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  44.74 
 
 		 842 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  42.01 
 
 		 908 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  46.25 
 
 		 845 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  47.21 
 
 		 862 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  47.21 
 
 		 862 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  47.1 
 
 		 863 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  46.22 
 
 		 896 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  44.93 
 
 		 833 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  47.19 
 
 		 894 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  42.19 
 
 		 896 aa  465  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  40.2 
 
 		 858 aa  466  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  45.49 
 
 		 857 aa  464  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  45.85 
 
 		 881 aa  464  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  41.73 
 
 		 907 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  46.44 
 
 		 862 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  43.09 
 
 		 837 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  38.79 
 
 		 912 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  45.16 
 
 		 869 aa  462  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  43.57 
 
 		 844 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  42.59 
 
 		 931 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  44.65 
 
 		 886 aa  462  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  42.25 
 
 		 912 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  41.11 
 
 		 914 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  43.94 
 
 		 899 aa  459  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  40.34 
 
 		 906 aa  458  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  41.81 
 
 		 907 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  43.51 
 
 		 873 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  47.01 
 
 		 868 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  43.85 
 
 		 907 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>