More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1018 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  41.8 
 
 		 968 aa  700    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  49.66 
 
 		 1114 aa  955    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  47.32 
 
 		 1113 aa  975    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  39.28 
 
 		 920 aa  676    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  38.33 
 
 		 1032 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  41.14 
 
 		 915 aa  713    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  39.7 
 
 		 896 aa  698    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  39.51 
 
 		 896 aa  695    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  78.73 
 
 		 1027 aa  1661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  42.6 
 
 		 867 aa  714    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  81.6 
 
 		 1024 aa  1748    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  41.73 
 
 		 890 aa  683    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  69.9 
 
 		 1029 aa  1510    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  77.98 
 
 		 1024 aa  1659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 1017 aa  2098    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  40.09 
 
 		 917 aa  699    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  47.14 
 
 		 1117 aa  877    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  48.24 
 
 		 1117 aa  967    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  40.23 
 
 		 917 aa  704    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  37.18 
 
 		 1010 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.34 
 
 		 1136 aa  1066    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  37.77 
 
 		 925 aa  662    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  47.9 
 
 		 1118 aa  990    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  46.92 
 
 		 1130 aa  949    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  47.58 
 
 		 1118 aa  956    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  50.2 
 
 		 1114 aa  972    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  45.23 
 
 		 1004 aa  860    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  41.47 
 
 		 910 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  46.36 
 
 		 1116 aa  922    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  71.48 
 
 		 1031 aa  1541    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  77.35 
 
 		 1022 aa  1632    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  41.14 
 
 		 915 aa  720    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  49.8 
 
 		 1120 aa  954    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  50.36 
 
 		 1102 aa  1044    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  51.26 
 
 		 859 aa  601  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  48.37 
 
 		 894 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  48.38 
 
 		 833 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  51.03 
 
 		 864 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  47.1 
 
 		 830 aa  561  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  43.89 
 
 		 896 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  50.97 
 
 		 848 aa  554  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  48.2 
 
 		 896 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  45.14 
 
 		 886 aa  551  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  44.66 
 
 		 836 aa  551  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  45.1 
 
 		 834 aa  552  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  50.17 
 
 		 838 aa  551  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 908 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  50.87 
 
 		 844 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  51.56 
 
 		 836 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  44.41 
 
 		 872 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  48.91 
 
 		 869 aa  545  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  45.65 
 
 		 845 aa  545  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  46.78 
 
 		 858 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 908 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  48.18 
 
 		 899 aa  545  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 908 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  43.47 
 
 		 908 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  44.97 
 
 		 911 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  44.97 
 
 		 908 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  44.97 
 
 		 908 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  44.97 
 
 		 908 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  44.9 
 
 		 909 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  45.55 
 
 		 845 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  44.67 
 
 		 908 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  45.39 
 
 		 897 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  49.5 
 
 		 863 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  41.45 
 
 		 944 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 		 835 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 		 899 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 		 835 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  45.62 
 
 		 897 aa  538  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  43.96 
 
 		 900 aa  537  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  47.84 
 
 		 925 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  45.4 
 
 		 840 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  44.81 
 
 		 910 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  44.49 
 
 		 840 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  43.32 
 
 		 835 aa  536  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  43.32 
 
 		 835 aa  534  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  43.32 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  47.81 
 
 		 862 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  44 
 
 		 907 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  43.77 
 
 		 907 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  47.65 
 
 		 862 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  44.15 
 
 		 907 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  44.03 
 
 		 906 aa  536  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  43.68 
 
 		 907 aa  535  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  47.82 
 
 		 897 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  48.94 
 
 		 858 aa  532  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0922  preprotein translocase subunit SecA  35.31 
 
 		 921 aa  531  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.666696  normal  0.803255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  44.69 
 
 		 873 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  47.18 
 
 		 857 aa  531  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  43.03 
 
 		 835 aa  532  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  43.03 
 
 		 835 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  47.32 
 
 		 862 aa  531  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  47.14 
 
 		 908 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  47.55 
 
 		 914 aa  532  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  47.75 
 
 		 855 aa  531  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>