More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0271 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00099  translocase  39.46 
 
 		 901 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  39.46 
 
 		 901 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  39.39 
 
 		 968 aa  660    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  38.65 
 
 		 907 aa  696    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  37.06 
 
 		 911 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  57.64 
 
 		 1113 aa  1316    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  38.47 
 
 		 904 aa  689    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  38.81 
 
 		 909 aa  708    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  62.59 
 
 		 1120 aa  1365    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  38.4 
 
 		 911 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  59.96 
 
 		 1117 aa  1331    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  38.58 
 
 		 908 aa  705    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  36.41 
 
 		 913 aa  670    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  55.07 
 
 		 1116 aa  1178    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  49.37 
 
 		 1027 aa  1015    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  38.47 
 
 		 904 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  36.31 
 
 		 913 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  36.98 
 
 		 939 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  39.54 
 
 		 901 aa  696    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  39.26 
 
 		 910 aa  713    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  37.46 
 
 		 915 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  38.56 
 
 		 934 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  36.5 
 
 		 911 aa  663    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  50.32 
 
 		 1024 aa  1041    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  50.32 
 
 		 1017 aa  1040    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  38.49 
 
 		 908 aa  700    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 		 1029 aa  1019    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  38.04 
 
 		 916 aa  696    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 1102 aa  2273    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  63.37 
 
 		 1114 aa  1375    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  39.46 
 
 		 901 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  38.62 
 
 		 909 aa  675    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  38.4 
 
 		 908 aa  698    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  41.8 
 
 		 1117 aa  793    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  39.46 
 
 		 901 aa  696    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  38.47 
 
 		 904 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  50.41 
 
 		 1024 aa  1055    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  39.1 
 
 		 897 aa  695    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  64.76 
 
 		 1118 aa  1489    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  38.69 
 
 		 858 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 		 1031 aa  1037    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  64.75 
 
 		 1130 aa  1370    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  40.94 
 
 		 939 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  62.39 
 
 		 1118 aa  1344    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  50.21 
 
 		 1136 aa  1095    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  38.76 
 
 		 908 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  38.76 
 
 		 908 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  38.67 
 
 		 906 aa  702    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  42.16 
 
 		 1004 aa  820    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  39.46 
 
 		 901 aa  696    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  38.49 
 
 		 916 aa  698    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  38.4 
 
 		 908 aa  698    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  37.65 
 
 		 917 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  39.46 
 
 		 901 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  39.46 
 
 		 901 aa  696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  38.85 
 
 		 907 aa  698    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  38.76 
 
 		 908 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  36.5 
 
 		 911 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  39.37 
 
 		 901 aa  694    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  50.18 
 
 		 1022 aa  1037    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  39.37 
 
 		 908 aa  726    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  63.71 
 
 		 1114 aa  1367    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  37.48 
 
 		 921 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  36.02 
 
 		 930 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  36.21 
 
 		 917 aa  617  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  36.43 
 
 		 922 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  36.47 
 
 		 930 aa  612  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  34.98 
 
 		 898 aa  594  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0434  preprotein translocase subunit SecA  35.95 
 
 		 952 aa  587  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  40.99 
 
 		 890 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  37.24 
 
 		 970 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  34.53 
 
 		 1024 aa  555  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  34.75 
 
 		 992 aa  552  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  47.42 
 
 		 859 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  43.31 
 
 		 830 aa  533  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  46.03 
 
 		 833 aa  522  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  42.3 
 
 		 845 aa  514  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  43.91 
 
 		 864 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  42.47 
 
 		 834 aa  515  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  44.08 
 
 		 837 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  41.62 
 
 		 907 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  39.47 
 
 		 914 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  41.3 
 
 		 866 aa  509  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  40.67 
 
 		 907 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  39.47 
 
 		 914 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  41.69 
 
 		 906 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  41.75 
 
 		 896 aa  505  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  44.73 
 
 		 844 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 		 872 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  43.48 
 
 		 894 aa  505  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  42.25 
 
 		 907 aa  506  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  40.4 
 
 		 848 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  41.78 
 
 		 907 aa  502  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  41.23 
 
 		 886 aa  502  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  39.65 
 
 		 916 aa  500  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 858 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 900 aa  499  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  44.19 
 
 		 845 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  45.07 
 
 		 840 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  40.72 
 
 		 901 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>