More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0128 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  37.82 
 
 		 968 aa  649    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  55.32 
 
 		 1113 aa  1211    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  49.07 
 
 		 1031 aa  963    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  57.12 
 
 		 1117 aa  1269    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  48.6 
 
 		 1029 aa  976    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  57.32 
 
 		 1120 aa  1269    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  45.55 
 
 		 1117 aa  747    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  47.87 
 
 		 1024 aa  967    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  47.62 
 
 		 1017 aa  951    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  47.38 
 
 		 1136 aa  992    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  62.39 
 
 		 1102 aa  1344    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  54.4 
 
 		 1116 aa  1252    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  62.04 
 
 		 1130 aa  1443    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  43.01 
 
 		 1004 aa  773    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  61.25 
 
 		 1114 aa  1414    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  59.71 
 
 		 1118 aa  1299    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 1118 aa  2304    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  49.66 
 
 		 1027 aa  962    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  57.05 
 
 		 1114 aa  1271    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  38.05 
 
 		 908 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  47.84 
 
 		 1024 aa  963    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  48.11 
 
 		 1022 aa  942    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  41.52 
 
 		 909 aa  631  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  42.02 
 
 		 908 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  38.24 
 
 		 921 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  41.37 
 
 		 908 aa  624  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  39.04 
 
 		 906 aa  619  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  37.7 
 
 		 934 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  37.43 
 
 		 930 aa  615  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  41.48 
 
 		 867 aa  615  9.999999999999999e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  37.33 
 
 		 866 aa  614  9.999999999999999e-175  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  40.64 
 
 		 906 aa  615  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  36.9 
 
 		 924 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  42.82 
 
 		 863 aa  610  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  36.85 
 
 		 908 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  40.51 
 
 		 858 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  36.63 
 
 		 1024 aa  601  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  38.97 
 
 		 970 aa  597  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  37.43 
 
 		 910 aa  597  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  40.39 
 
 		 908 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  39.81 
 
 		 911 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  39.81 
 
 		 908 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  37.8 
 
 		 934 aa  595  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  36.71 
 
 		 992 aa  594  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  39.81 
 
 		 908 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  37.28 
 
 		 1010 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  39.7 
 
 		 908 aa  592  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  35.96 
 
 		 910 aa  578  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  35.88 
 
 		 904 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  35.88 
 
 		 904 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  35.88 
 
 		 904 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  34.95 
 
 		 910 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  35.66 
 
 		 1032 aa  556  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  45.24 
 
 		 859 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  43.44 
 
 		 840 aa  492  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  41.94 
 
 		 886 aa  492  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  48.64 
 
 		 796 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  41.93 
 
 		 845 aa  476  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  44.93 
 
 		 830 aa  475  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  41.64 
 
 		 864 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  43.83 
 
 		 834 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  45.86 
 
 		 840 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  45.68 
 
 		 845 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  43.54 
 
 		 881 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  44.63 
 
 		 833 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  45.59 
 
 		 848 aa  463  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  44.81 
 
 		 837 aa  459  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  43.2 
 
 		 836 aa  459  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  40.11 
 
 		 896 aa  459  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 858 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  42.57 
 
 		 899 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  42.26 
 
 		 931 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  45.16 
 
 		 844 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  42.88 
 
 		 899 aa  452  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 894 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  39.97 
 
 		 873 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  43.31 
 
 		 837 aa  452  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  43 
 
 		 909 aa  452  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  42.69 
 
 		 897 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  38.71 
 
 		 980 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  42.67 
 
 		 884 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 835 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 835 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 835 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  45.68 
 
 		 838 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  43.67 
 
 		 872 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  40.17 
 
 		 944 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  46.74 
 
 		 868 aa  449  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  38.53 
 
 		 903 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  39.94 
 
 		 912 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 835 aa  446  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 835 aa  445  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 835 aa  446  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  42.49 
 
 		 835 aa  445  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  39.12 
 
 		 912 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  39.24 
 
 		 899 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  42.49 
 
 		 835 aa  446  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 835 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  42.12 
 
 		 835 aa  446  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  40.25 
 
 		 901 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>