More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0465 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  40.02 
 
 		 968 aa  684    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  48.49 
 
 		 1027 aa  955    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  59.18 
 
 		 1113 aa  1333    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  37.89 
 
 		 912 aa  645    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  47.82 
 
 		 1029 aa  957    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  44.57 
 
 		 1004 aa  789    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  42.55 
 
 		 862 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  38.59 
 
 		 915 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  37.47 
 
 		 914 aa  644    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  38.66 
 
 		 862 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  62.59 
 
 		 1102 aa  1365    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  57.17 
 
 		 1130 aa  1279    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  52.62 
 
 		 1116 aa  1145    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  48.81 
 
 		 1024 aa  972    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  49.8 
 
 		 1017 aa  954    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  39.81 
 
 		 899 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  38.55 
 
 		 863 aa  642    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  42.63 
 
 		 1117 aa  809    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  38.04 
 
 		 916 aa  639    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  37.56 
 
 		 914 aa  645    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  57.08 
 
 		 1114 aa  1276    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  63.28 
 
 		 1118 aa  1333    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  45.08 
 
 		 869 aa  652    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  57.32 
 
 		 1118 aa  1269    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  38.87 
 
 		 899 aa  651    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  45.61 
 
 		 868 aa  635    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  37.53 
 
 		 913 aa  636    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  71.29 
 
 		 1114 aa  1676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  38.97 
 
 		 866 aa  657    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.31 
 
 		 1136 aa  1058    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 1120 aa  2310    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  50.53 
 
 		 1031 aa  974    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  48.27 
 
 		 1024 aa  968    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  48.35 
 
 		 1022 aa  970    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  41.18 
 
 		 939 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  37.69 
 
 		 908 aa  641    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  42.89 
 
 		 862 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  71.79 
 
 		 1117 aa  1693    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  37.62 
 
 		 910 aa  635  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  38.5 
 
 		 897 aa  633  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  42.44 
 
 		 890 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  38.04 
 
 		 897 aa  635  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  36.98 
 
 		 911 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  36.98 
 
 		 939 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  38.47 
 
 		 867 aa  632  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  37.12 
 
 		 903 aa  627  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  38.67 
 
 		 858 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  37.21 
 
 		 917 aa  624  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  37.3 
 
 		 916 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  36.92 
 
 		 906 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  37.07 
 
 		 910 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  37.55 
 
 		 911 aa  622  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  37.37 
 
 		 911 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  38.07 
 
 		 921 aa  622  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  43.53 
 
 		 855 aa  620  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  37.99 
 
 		 915 aa  619  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  36.57 
 
 		 907 aa  617  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  36.87 
 
 		 934 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  36.27 
 
 		 907 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  37.9 
 
 		 919 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  38.65 
 
 		 930 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  38.01 
 
 		 917 aa  610  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  37 
 
 		 1024 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  37.91 
 
 		 917 aa  611  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  36.79 
 
 		 904 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  36.53 
 
 		 921 aa  608  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  36.79 
 
 		 904 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  36.79 
 
 		 904 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  36.45 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  36.45 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  37.33 
 
 		 913 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  36.45 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  36.45 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  36.74 
 
 		 913 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  36.54 
 
 		 901 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  36.45 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  36.45 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  36.45 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  36.45 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  37.93 
 
 		 1010 aa  605  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  36.06 
 
 		 930 aa  601  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  42.87 
 
 		 859 aa  602  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  41.39 
 
 		 918 aa  598  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  41.07 
 
 		 904 aa  597  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  37.58 
 
 		 934 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  37.17 
 
 		 909 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  36.94 
 
 		 909 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  36.04 
 
 		 921 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  34.9 
 
 		 920 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  34.99 
 
 		 924 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  38.96 
 
 		 970 aa  567  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 917 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  40.8 
 
 		 992 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1214  preprotein translocase subunit SecA  40.75 
 
 		 871 aa  553  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  40.63 
 
 		 871 aa  551  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  34.59 
 
 		 1032 aa  548  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1058  preprotein translocase subunit SecA  39.52 
 
 		 869 aa  541  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.981267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0411  preprotein translocase subunit SecA  34.64 
 
 		 952 aa  532  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0851179  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  44.61 
 
 		 899 aa  521  1e-146  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0589  preprotein translocase subunit SecA  44.51 
 
 		 853 aa  515  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>