More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1311 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  39.76 
 
 		 910 aa  689    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  72.65 
 
 		 1031 aa  1567    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  42.14 
 
 		 968 aa  712    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  41.22 
 
 		 899 aa  759    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  43.77 
 
 		 897 aa  773    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  40.17 
 
 		 911 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  47.58 
 
 		 1113 aa  994    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  40.76 
 
 		 922 aa  724    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  37.99 
 
 		 1010 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  41.68 
 
 		 838 aa  716    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  46.86 
 
 		 1004 aa  889    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  41.62 
 
 		 890 aa  678    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  38.89 
 
 		 913 aa  678    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  49.46 
 
 		 1118 aa  1015    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  38.58 
 
 		 913 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  40.73 
 
 		 912 aa  692    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  39.62 
 
 		 904 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  40.43 
 
 		 910 aa  712    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  47.99 
 
 		 1117 aa  972    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  39.74 
 
 		 911 aa  708    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  37.8 
 
 		 925 aa  663    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  81.27 
 
 		 1024 aa  1734    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  81.6 
 
 		 1017 aa  1729    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 		 899 aa  787    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  39.13 
 
 		 910 aa  661    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  49.95 
 
 		 1114 aa  956    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  47.28 
 
 		 1116 aa  911    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  39.62 
 
 		 904 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  39.74 
 
 		 917 aa  697    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  40.02 
 
 		 939 aa  722    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  40.08 
 
 		 907 aa  704    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  47.96 
 
 		 1117 aa  883    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  48.27 
 
 		 1120 aa  968    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.26 
 
 		 1136 aa  1067    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  81.69 
 
 		 1027 aa  1734    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  39.62 
 
 		 904 aa  689    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  38.93 
 
 		 903 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  73.66 
 
 		 1029 aa  1582    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  47.84 
 
 		 1118 aa  963    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  42.6 
 
 		 867 aa  711    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  49.46 
 
 		 1130 aa  949    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  40.32 
 
 		 897 aa  722    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  40.62 
 
 		 914 aa  708    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  40.6 
 
 		 918 aa  714    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  39.42 
 
 		 899 aa  678    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  40.49 
 
 		 921 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  39.92 
 
 		 911 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 1024 aa  2102    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  50.41 
 
 		 1102 aa  1055    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  80.25 
 
 		 1022 aa  1705    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  50.1 
 
 		 1114 aa  974    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  39.92 
 
 		 939 aa  715    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  38.93 
 
 		 906 aa  681    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  40.65 
 
 		 919 aa  716    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  36.65 
 
 		 1032 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  45.74 
 
 		 859 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  36.83 
 
 		 992 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  36.54 
 
 		 1024 aa  585  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  45.51 
 
 		 886 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  44.68 
 
 		 864 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  47.54 
 
 		 894 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  45.92 
 
 		 830 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  44.59 
 
 		 845 aa  547  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  45.9 
 
 		 834 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  48.11 
 
 		 884 aa  543  1e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  43.98 
 
 		 836 aa  545  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  47.71 
 
 		 833 aa  546  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  44.48 
 
 		 897 aa  542  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  43.93 
 
 		 907 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  44.54 
 
 		 848 aa  542  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  46.16 
 
 		 836 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  44.17 
 
 		 908 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  47.63 
 
 		 896 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  48.68 
 
 		 925 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  43.7 
 
 		 900 aa  537  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  43.15 
 
 		 835 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  47.12 
 
 		 862 aa  534  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  43 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  43 
 
 		 835 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  43 
 
 		 835 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  43 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  43.15 
 
 		 835 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  46.95 
 
 		 862 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  43.29 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  43.15 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  43 
 
 		 835 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  47.45 
 
 		 862 aa  532  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  41.33 
 
 		 944 aa  532  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  46.02 
 
 		 844 aa  532  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  44.93 
 
 		 858 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  48.52 
 
 		 869 aa  532  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  43.11 
 
 		 906 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  47.66 
 
 		 896 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  44.33 
 
 		 842 aa  529  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  42.92 
 
 		 835 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  42.22 
 
 		 896 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  42 
 
 		 962 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  41.87 
 
 		 962 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  43.9 
 
 		 837 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  43.53 
 
 		 863 aa  528  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>