More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0997 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  74.52 
 
 		 1027 aa  1569    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  48.77 
 
 		 1120 aa  990    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  42.32 
 
 		 968 aa  725    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  46.04 
 
 		 1116 aa  927    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  39.76 
 
 		 911 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  47.53 
 
 		 1113 aa  1021    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  41.69 
 
 		 867 aa  691    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  49.75 
 
 		 1114 aa  981    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  39.78 
 
 		 911 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  38.48 
 
 		 913 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  47.72 
 
 		 1117 aa  977    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.78 
 
 		 1136 aa  1082    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  38.74 
 
 		 913 aa  690    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  40.2 
 
 		 925 aa  722    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  49.1 
 
 		 1102 aa  1051    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  39.46 
 
 		 924 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  74.93 
 
 		 1029 aa  1616    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  72.19 
 
 		 1024 aa  1563    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  71.73 
 
 		 1017 aa  1537    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  41.83 
 
 		 890 aa  686    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  47.12 
 
 		 1004 aa  890    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  39.96 
 
 		 939 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  48.78 
 
 		 1114 aa  958    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  40.16 
 
 		 910 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  47.02 
 
 		 1117 aa  884    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  37.74 
 
 		 1024 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  40.15 
 
 		 934 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 1031 aa  2118    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  39.79 
 
 		 907 aa  725    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  48.72 
 
 		 1118 aa  1020    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  39.96 
 
 		 915 aa  697    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  46.95 
 
 		 1118 aa  979    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  39.66 
 
 		 908 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  39.48 
 
 		 908 aa  722    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  39.33 
 
 		 865 aa  638    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  49.36 
 
 		 1130 aa  978    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  72.65 
 
 		 1024 aa  1584    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  40.06 
 
 		 911 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  73.26 
 
 		 1022 aa  1557    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0589  preprotein translocase subunit SecA  41.95 
 
 		 853 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  47.81 
 
 		 859 aa  602  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  49.69 
 
 		 845 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  49.24 
 
 		 840 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  44.4 
 
 		 908 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  49.2 
 
 		 862 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  45.55 
 
 		 830 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  49.04 
 
 		 862 aa  556  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  46 
 
 		 834 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  49.2 
 
 		 862 aa  555  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  44.19 
 
 		 845 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  46.1 
 
 		 848 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  50.08 
 
 		 884 aa  555  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  51.02 
 
 		 833 aa  555  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  46.28 
 
 		 896 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  43.97 
 
 		 939 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  51.19 
 
 		 844 aa  549  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  48.73 
 
 		 869 aa  547  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  45.83 
 
 		 858 aa  549  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  46.34 
 
 		 864 aa  547  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  45.63 
 
 		 886 aa  547  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  44.7 
 
 		 917 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  43.96 
 
 		 836 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  44.48 
 
 		 916 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  47.4 
 
 		 908 aa  544  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  44.12 
 
 		 906 aa  545  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  48.08 
 
 		 863 aa  543  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  44.04 
 
 		 840 aa  545  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  47.81 
 
 		 912 aa  546  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  44.18 
 
 		 897 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  47.82 
 
 		 925 aa  542  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  46.64 
 
 		 894 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  46.09 
 
 		 838 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  42.67 
 
 		 896 aa  542  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 907 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  43.43 
 
 		 907 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  48.64 
 
 		 868 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  44.24 
 
 		 916 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  43.67 
 
 		 908 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  43.04 
 
 		 909 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  44.25 
 
 		 837 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  44.31 
 
 		 842 aa  539  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  43.81 
 
 		 835 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  43.38 
 
 		 835 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  43.99 
 
 		 907 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  47.16 
 
 		 903 aa  539  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  43.71 
 
 		 900 aa  538  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  43.38 
 
 		 835 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  47.02 
 
 		 908 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  43.45 
 
 		 873 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  47.59 
 
 		 858 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  44.4 
 
 		 837 aa  536  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  43.38 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  43.83 
 
 		 908 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  46.35 
 
 		 857 aa  535  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  43.52 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  43.38 
 
 		 835 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  43.52 
 
 		 835 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  43.83 
 
 		 908 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  43.38 
 
 		 835 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  47.44 
 
 		 855 aa  536  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>