More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1088 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  41.62 
 
 
968 aa  714    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  39.92 
 
 
836 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  37.35 
 
 
911 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  47.17 
 
 
1113 aa  998    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  45.95 
 
 
1004 aa  880    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  39.53 
 
 
904 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  49.08 
 
 
1114 aa  986    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  49.46 
 
 
1114 aa  951    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  39.75 
 
 
838 aa  648    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  38.81 
 
 
970 aa  642    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.6 
 
 
1136 aa  1069    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  48.81 
 
 
1120 aa  972    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  46.96 
 
 
1116 aa  917    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  38.4 
 
 
924 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  40.13 
 
 
914 aa  696    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  50.32 
 
 
1102 aa  1041    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  81.27 
 
 
1024 aa  1734    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  41.02 
 
 
902 aa  748    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  40.53 
 
 
925 aa  659    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
1024 aa  2102    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  77.98 
 
 
1017 aa  1642    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  42.49 
 
 
899 aa  766    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  47.15 
 
 
1117 aa  971    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  71.65 
 
 
1029 aa  1541    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  39.53 
 
 
904 aa  702    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  37.74 
 
 
917 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  38.27 
 
 
907 aa  656    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  40.36 
 
 
897 aa  728    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  72.09 
 
 
1031 aa  1544    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  38.63 
 
 
908 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  38.45 
 
 
925 aa  677    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  50.36 
 
 
1118 aa  1028    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  78.2 
 
 
1027 aa  1661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  38.29 
 
 
930 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  38.16 
 
 
903 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  37.74 
 
 
907 aa  641    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  48.06 
 
 
1117 aa  889    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  47.87 
 
 
1118 aa  967    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  41.9 
 
 
890 aa  697    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  41.49 
 
 
867 aa  710    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  48.92 
 
 
1130 aa  937    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  39.88 
 
 
830 aa  670    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  37.81 
 
 
1024 aa  660    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  37.33 
 
 
907 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 
915 aa  708    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  39.94 
 
 
914 aa  699    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  41.49 
 
 
899 aa  680    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  78.3 
 
 
1022 aa  1659    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  38.98 
 
 
908 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  39.53 
 
 
904 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  37.25 
 
 
939 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  37.09 
 
 
992 aa  635  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  37.58 
 
 
921 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  37.1 
 
 
909 aa  628  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  37.05 
 
 
1032 aa  628  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  37.16 
 
 
911 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  36.48 
 
 
893 aa  625  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  37.27 
 
 
909 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  38.23 
 
 
918 aa  618  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  38.34 
 
 
865 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  36.58 
 
 
922 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  37.24 
 
 
1010 aa  602  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  45.89 
 
 
859 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  38.46 
 
 
904 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  48.38 
 
 
864 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  44.64 
 
 
886 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  45.45 
 
 
897 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  47.74 
 
 
833 aa  554  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  45.86 
 
 
834 aa  547  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  47.8 
 
 
844 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  47.27 
 
 
862 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  49.32 
 
 
845 aa  548  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  47.48 
 
 
884 aa  543  1e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  42.8 
 
 
962 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  47.44 
 
 
862 aa  544  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  44.11 
 
 
836 aa  545  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  47.19 
 
 
863 aa  544  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  42.8 
 
 
962 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  42.8 
 
 
962 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 
910 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  43.99 
 
 
900 aa  545  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  47.27 
 
 
862 aa  546  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  46.67 
 
 
894 aa  545  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  45.15 
 
 
842 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  50.44 
 
 
848 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  49.38 
 
 
840 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  43.78 
 
 
908 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  45.81 
 
 
896 aa  538  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  45.77 
 
 
858 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  43.88 
 
 
901 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  43.29 
 
 
835 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  43.84 
 
 
901 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  43.43 
 
 
835 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  45.07 
 
 
917 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  44.26 
 
 
907 aa  535  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  43.84 
 
 
901 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  43.84 
 
 
901 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  45.01 
 
 
912 aa  534  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  44.33 
 
 
901 aa  536  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  43.78 
 
 
908 aa  534  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>