More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0369 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  42.87 
 
 		 1004 aa  798    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  40.04 
 
 		 968 aa  715    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  46.56 
 
 		 1116 aa  952    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  48.35 
 
 		 1113 aa  1073    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  44.9 
 
 		 1117 aa  834    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 1136 aa  2304    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  49.35 
 
 		 1024 aa  1073    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  46.23 
 
 		 1114 aa  976    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  49.96 
 
 		 1024 aa  1082    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  49.25 
 
 		 1017 aa  1072    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  49.87 
 
 		 1031 aa  1074    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  50.13 
 
 		 1102 aa  1106    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  49.6 
 
 		 1027 aa  1050    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  49.44 
 
 		 1120 aa  1065    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  47.47 
 
 		 1118 aa  1000    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  47.67 
 
 		 1114 aa  1046    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  48.25 
 
 		 1029 aa  1058    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  46.76 
 
 		 1117 aa  1023    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  49.86 
 
 		 1130 aa  1007    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  49.21 
 
 		 1022 aa  1053    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  49.66 
 
 		 1118 aa  1110    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  47.07 
 
 		 848 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  47.25 
 
 		 859 aa  548  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  47.69 
 
 		 830 aa  545  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  41.59 
 
 		 908 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  44.66 
 
 		 894 aa  538  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  45.73 
 
 		 899 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  45.13 
 
 		 881 aa  534  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  47.05 
 
 		 837 aa  532  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  39.61 
 
 		 903 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  47.68 
 
 		 864 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  41.54 
 
 		 909 aa  531  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  46.98 
 
 		 834 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  46.85 
 
 		 840 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  46.85 
 
 		 845 aa  532  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  41.3 
 
 		 908 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  41.3 
 
 		 908 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  45.81 
 
 		 845 aa  533  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  41.41 
 
 		 908 aa  529  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  41.28 
 
 		 911 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  41.3 
 
 		 908 aa  529  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  41.28 
 
 		 908 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  41.28 
 
 		 908 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  44.55 
 
 		 908 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  44.16 
 
 		 836 aa  525  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  44.58 
 
 		 899 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  45.14 
 
 		 886 aa  523  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  44.8 
 
 		 907 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  39.95 
 
 		 897 aa  525  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  47 
 
 		 840 aa  524  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  45.27 
 
 		 896 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  40.83 
 
 		 922 aa  520  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  45.93 
 
 		 837 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  44.07 
 
 		 907 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  44.68 
 
 		 907 aa  523  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  43.22 
 
 		 896 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 		 907 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  48.8 
 
 		 844 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  44.55 
 
 		 907 aa  522  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  40.84 
 
 		 906 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  44.04 
 
 		 833 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1214  preprotein translocase subunit SecA  50.37 
 
 		 871 aa  516  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  44.01 
 
 		 872 aa  516  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  40.95 
 
 		 917 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  41.13 
 
 		 909 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  46.33 
 
 		 858 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  43.34 
 
 		 866 aa  513  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 871 aa  512  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  44.34 
 
 		 897 aa  512  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  44.09 
 
 		 873 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  45.74 
 
 		 858 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  44.34 
 
 		 923 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  44.89 
 
 		 896 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  43.2 
 
 		 835 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  42.88 
 
 		 835 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  42.88 
 
 		 835 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  42.88 
 
 		 835 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  43.2 
 
 		 835 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  43.04 
 
 		 835 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  42.88 
 
 		 835 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  43.04 
 
 		 835 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  42.88 
 
 		 835 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  42.71 
 
 		 842 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  41.71 
 
 		 903 aa  505  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  43.01 
 
 		 902 aa  505  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  42.3 
 
 		 904 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2761  preprotein translocase subunit SecA  39.95 
 
 		 906 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  42.56 
 
 		 908 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  40.23 
 
 		 939 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0589  preprotein translocase subunit SecA  49.44 
 
 		 853 aa  504  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  43.81 
 
 		 843 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  43.41 
 
 		 901 aa  505  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  45.48 
 
 		 838 aa  505  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  44.24 
 
 		 897 aa  505  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0794  preprotein translocase subunit SecA  43.81 
 
 		 843 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  42.31 
 
 		 914 aa  502  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  42.5 
 
 		 962 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  39.97 
 
 		 908 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  39.62 
 
 		 895 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  42.64 
 
 		 962 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>