More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1206 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  48.49 
 
 
1120 aa  960    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  41.84 
 
 
968 aa  712    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  46.7 
 
 
1117 aa  958    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  47.22 
 
 
1113 aa  971    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  49.85 
 
 
1114 aa  946    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  81.69 
 
 
1024 aa  1750    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  40.02 
 
 
917 aa  701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  43.06 
 
 
867 aa  722    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
1027 aa  2106    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  78.2 
 
 
1024 aa  1677    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  78.73 
 
 
1017 aa  1660    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 
899 aa  682    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  44.89 
 
 
890 aa  688    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.34 
 
 
1136 aa  1050    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  46.75 
 
 
1116 aa  897    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  40.32 
 
 
914 aa  697    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  49.02 
 
 
1130 aa  944    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  49.15 
 
 
1118 aa  999    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  49.37 
 
 
1102 aa  1022    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  40.6 
 
 
914 aa  695    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  49.76 
 
 
1118 aa  963    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  72.11 
 
 
1029 aa  1551    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  47.44 
 
 
1117 aa  878    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  49.66 
 
 
1114 aa  961    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  74.32 
 
 
1031 aa  1569    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  46.77 
 
 
1004 aa  895    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  82.85 
 
 
1022 aa  1746    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  37.77 
 
 
925 aa  659    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  40.68 
 
 
906 aa  722    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  47.13 
 
 
859 aa  591  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  44.43 
 
 
908 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  46.14 
 
 
834 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  48.78 
 
 
884 aa  550  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  50.34 
 
 
864 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  45.04 
 
 
848 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  46.09 
 
 
830 aa  551  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  44.68 
 
 
886 aa  549  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  44.48 
 
 
900 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  45.36 
 
 
910 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  44.33 
 
 
907 aa  549  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  44.72 
 
 
897 aa  548  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  47.38 
 
 
833 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  45.82 
 
 
845 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  44.67 
 
 
897 aa  545  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 
906 aa  545  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  48.23 
 
 
863 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  47.08 
 
 
894 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  44.75 
 
 
908 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  48.43 
 
 
899 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  43.68 
 
 
897 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  47.97 
 
 
896 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  44.18 
 
 
916 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  47.63 
 
 
925 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  45.48 
 
 
840 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  45.34 
 
 
845 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  44.3 
 
 
908 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  49.31 
 
 
836 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  45.03 
 
 
840 aa  542  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  44.3 
 
 
908 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  44.54 
 
 
842 aa  539  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  44.38 
 
 
907 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  44.79 
 
 
907 aa  538  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  47.98 
 
 
862 aa  539  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  42.13 
 
 
944 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  48.1 
 
 
899 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  48.11 
 
 
862 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  47.98 
 
 
862 aa  538  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  45.98 
 
 
858 aa  539  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  42.8 
 
 
908 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  43.92 
 
 
872 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  44.13 
 
 
901 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  44.05 
 
 
904 aa  536  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  44.05 
 
 
904 aa  536  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  44.7 
 
 
838 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  43.71 
 
 
896 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  48.14 
 
 
868 aa  535  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  45.15 
 
 
836 aa  536  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  47.4 
 
 
931 aa  534  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  45.45 
 
 
844 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  43.27 
 
 
896 aa  536  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  43.87 
 
 
909 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  49.26 
 
 
796 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  44.2 
 
 
907 aa  536  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  43.91 
 
 
907 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  44.05 
 
 
904 aa  536  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  44.26 
 
 
907 aa  535  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  44.08 
 
 
939 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  44.67 
 
 
902 aa  535  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  44.31 
 
 
908 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  48.46 
 
 
855 aa  533  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  44.72 
 
 
901 aa  535  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  44.13 
 
 
901 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  44.31 
 
 
908 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  44.31 
 
 
911 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  43.42 
 
 
896 aa  532  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  49.83 
 
 
858 aa  531  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  44.13 
 
 
901 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  44.13 
 
 
901 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  41.31 
 
 
962 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  47.91 
 
 
896 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>