More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0514 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  39.28 
 
 		 968 aa  652    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  37.4 
 
 		 915 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 1113 aa  2297    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  48.04 
 
 		 1029 aa  1007    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  37.04 
 
 		 1024 aa  638    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  37.75 
 
 		 863 aa  644    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  40.91 
 
 		 862 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  37.88 
 
 		 909 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  36.86 
 
 		 992 aa  638    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  57.09 
 
 		 1130 aa  1243    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  42.59 
 
 		 869 aa  657    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  47.22 
 
 		 1031 aa  1000    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  56.45 
 
 		 1118 aa  1297    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  57.52 
 
 		 1117 aa  1298    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  48.35 
 
 		 1136 aa  1063    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  57.64 
 
 		 1102 aa  1316    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  47.17 
 
 		 1024 aa  998    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  47.32 
 
 		 1017 aa  967    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  37.3 
 
 		 862 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  43.18 
 
 		 1004 aa  829    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  59.18 
 
 		 1120 aa  1333    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  38.24 
 
 		 868 aa  647    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  39.94 
 
 		 917 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  38.78 
 
 		 916 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  37.45 
 
 		 910 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  38.07 
 
 		 939 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  57.21 
 
 		 1114 aa  1299    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  47.22 
 
 		 1027 aa  959    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  37.3 
 
 		 862 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  55.32 
 
 		 1118 aa  1211    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  52.71 
 
 		 1116 aa  1142    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  37.76 
 
 		 906 aa  670    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  37.61 
 
 		 916 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  46.98 
 
 		 1022 aa  983    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  57.21 
 
 		 1114 aa  1245    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  43.32 
 
 		 1117 aa  784    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  38.25 
 
 		 908 aa  688    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  47.58 
 
 		 1024 aa  994    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  37.15 
 
 		 855 aa  632  1e-180  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  36.26 
 
 		 1032 aa  631  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  40.51 
 
 		 859 aa  617  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 		 824 aa  604  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  35.62 
 
 		 1010 aa  605  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  36.67 
 
 		 865 aa  566  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  42.64 
 
 		 907 aa  532  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  43.63 
 
 		 859 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  42.49 
 
 		 830 aa  531  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  41.86 
 
 		 907 aa  528  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  46.37 
 
 		 834 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  42.31 
 
 		 907 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  44.31 
 
 		 902 aa  522  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  41.72 
 
 		 907 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  44.22 
 
 		 842 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  43.41 
 
 		 908 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  41.67 
 
 		 886 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  43.86 
 
 		 864 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  40.82 
 
 		 907 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  41.61 
 
 		 901 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  41.12 
 
 		 900 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  42.73 
 
 		 911 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  41.29 
 
 		 897 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  41.29 
 
 		 903 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  41.95 
 
 		 866 aa  514  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  44.68 
 
 		 897 aa  516  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  41.53 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  41.53 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  41.75 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  41.75 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  41.75 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  42.73 
 
 		 908 aa  512  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  41.53 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  41.53 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  40.65 
 
 		 939 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  43.2 
 
 		 844 aa  512  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  42.73 
 
 		 908 aa  512  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  41.53 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  41.53 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  41.75 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  42.96 
 
 		 908 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  42.96 
 
 		 908 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  41.53 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  41.53 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  41.53 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  42.96 
 
 		 908 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  42.73 
 
 		 908 aa  512  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  43.63 
 
 		 833 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  40.52 
 
 		 911 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  41.12 
 
 		 916 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  45.17 
 
 		 896 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  43.48 
 
 		 907 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  43.71 
 
 		 909 aa  509  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  43.48 
 
 		 909 aa  505  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  41.28 
 
 		 911 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  43.68 
 
 		 909 aa  505  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  45.16 
 
 		 840 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  41.47 
 
 		 912 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  40.79 
 
 		 904 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  41.14 
 
 		 911 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  43.48 
 
 		 914 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  40.13 
 
 		 912 aa  502  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>