More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3555 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  40.14 
 
 		 1004 aa  702    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  38.04 
 
 		 968 aa  645    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  57.21 
 
 		 1113 aa  1245    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  38.96 
 
 		 858 aa  641    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  46.23 
 
 		 1136 aa  967    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  56.93 
 
 		 1117 aa  1288    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 1114 aa  2294    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  63.37 
 
 		 1102 aa  1375    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  57.08 
 
 		 1120 aa  1276    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  49.95 
 
 		 1024 aa  956    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  57.39 
 
 		 1114 aa  1296    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  49.46 
 
 		 1024 aa  951    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  49.66 
 
 		 1017 aa  955    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  60.93 
 
 		 1118 aa  1326    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  48.78 
 
 		 1031 aa  944    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  55.85 
 
 		 1116 aa  1289    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  61.25 
 
 		 1118 aa  1414    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  48.55 
 
 		 1029 aa  947    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  55.23 
 
 		 1027 aa  909    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  39.26 
 
 		 896 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  49.42 
 
 		 1022 aa  941    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  70.51 
 
 		 1130 aa  1643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  41.94 
 
 		 1117 aa  787    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  38.18 
 
 		 863 aa  634  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  38.38 
 
 		 866 aa  635  1e-180  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  39.39 
 
 		 894 aa  635  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  38.36 
 
 		 862 aa  631  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  37.28 
 
 		 848 aa  632  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  36.87 
 
 		 899 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  38.55 
 
 		 862 aa  632  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  38.15 
 
 		 919 aa  629  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  38.32 
 
 		 862 aa  629  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  38.12 
 
 		 897 aa  621  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  38.45 
 
 		 921 aa  608  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  36.81 
 
 		 917 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  36.74 
 
 		 917 aa  605  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  37.08 
 
 		 899 aa  598  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  36.65 
 
 		 922 aa  598  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  36.74 
 
 		 1024 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  37.16 
 
 		 1010 aa  588  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  35.48 
 
 		 992 aa  587  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  36.06 
 
 		 921 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  36.72 
 
 		 917 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  36.29 
 
 		 921 aa  566  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1313  preprotein translocase subunit SecA  39.68 
 
 		 864 aa  531  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1058  preprotein translocase subunit SecA  37.96 
 
 		 869 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.981267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  45.39 
 
 		 834 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  47.26 
 
 		 796 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  42.01 
 
 		 859 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 864 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  42.07 
 
 		 886 aa  472  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  45.39 
 
 		 844 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  43.91 
 
 		 869 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  41.42 
 
 		 840 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  41.42 
 
 		 845 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  43.97 
 
 		 830 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  46.28 
 
 		 840 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  45.54 
 
 		 908 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  41.79 
 
 		 881 aa  465  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 908 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  40.56 
 
 		 873 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  42.13 
 
 		 868 aa  462  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  44.46 
 
 		 939 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  46.36 
 
 		 845 aa  462  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  43.94 
 
 		 833 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  45.1 
 
 		 931 aa  458  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  45.36 
 
 		 909 aa  458  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  45.54 
 
 		 908 aa  459  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  45.54 
 
 		 908 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  45.54 
 
 		 908 aa  459  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  43.99 
 
 		 902 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  45.65 
 
 		 907 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 		 909 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 908 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  41.64 
 
 		 842 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  40.44 
 
 		 837 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 911 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  44.2 
 
 		 857 aa  450  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  41.42 
 
 		 896 aa  452  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  40.72 
 
 		 912 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  40.83 
 
 		 858 aa  453  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  38.87 
 
 		 914 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 908 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 908 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  38.87 
 
 		 914 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  39.39 
 
 		 872 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 		 907 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  41.32 
 
 		 907 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  43.02 
 
 		 859 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  40.67 
 
 		 901 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  42.38 
 
 		 884 aa  449  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  44.56 
 
 		 907 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  43.48 
 
 		 907 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  37.96 
 
 		 836 aa  445  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  41.63 
 
 		 903 aa  445  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  39.34 
 
 		 903 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  41.03 
 
 		 896 aa  446  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  43.2 
 
 		 908 aa  446  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  41.83 
 
 		 906 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  40.49 
 
 		 944 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>