More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7284 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  39.18 
 
 		 968 aa  672    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  41.63 
 
 		 862 aa  657    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  37.43 
 
 		 916 aa  649    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  36.98 
 
 		 911 aa  656    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  56.72 
 
 		 1113 aa  1304    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  36.56 
 
 		 922 aa  640    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  37.65 
 
 		 920 aa  655    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  37.98 
 
 		 904 aa  694    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  37.26 
 
 		 915 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  53.15 
 
 		 1116 aa  1182    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  37.98 
 
 		 904 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  41.32 
 
 		 862 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  36.7 
 
 		 913 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  43.76 
 
 		 1117 aa  808    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  49.24 
 
 		 1027 aa  998    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  37.96 
 
 		 863 aa  662    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  36.79 
 
 		 913 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  41.59 
 
 		 869 aa  649    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  37.5 
 
 		 858 aa  636    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  37.02 
 
 		 939 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  48.21 
 
 		 1031 aa  992    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  38.67 
 
 		 934 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  37.45 
 
 		 911 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  50.13 
 
 		 1024 aa  1032    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  48.4 
 
 		 1017 aa  989    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  58.47 
 
 		 1117 aa  1341    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  37.78 
 
 		 913 aa  668    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  38.17 
 
 		 907 aa  669    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  60.34 
 
 		 1120 aa  1342    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  37.42 
 
 		 917 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  36.93 
 
 		 921 aa  651    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  47.86 
 
 		 1029 aa  1003    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  36.95 
 
 		 992 aa  644    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  37.67 
 
 		 921 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  49.46 
 
 		 1024 aa  1022    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  38.4 
 
 		 916 aa  695    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  43.75 
 
 		 1004 aa  834    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  59.89 
 
 		 1118 aa  1317    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  65.18 
 
 		 1102 aa  1494    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  62.09 
 
 		 1130 aa  1335    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  37.79 
 
 		 917 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  60.93 
 
 		 1114 aa  1334    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  36.53 
 
 		 911 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 1118 aa  2314    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  37.65 
 
 		 916 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  58.64 
 
 		 1114 aa  1322    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  37.88 
 
 		 939 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  37.87 
 
 		 917 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  49.83 
 
 		 1136 aa  1109    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3205  preprotein translocase, SecA subunit  37.55 
 
 		 1032 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  37.98 
 
 		 904 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  37.87 
 
 		 896 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  49.82 
 
 		 1022 aa  1017    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  41.32 
 
 		 862 aa  657    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  38.28 
 
 		 921 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  37.48 
 
 		 930 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  38.21 
 
 		 915 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  36.96 
 
 		 934 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  38.63 
 
 		 970 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  36.91 
 
 		 925 aa  625  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  36.37 
 
 		 922 aa  623  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  37.14 
 
 		 899 aa  566  1.0000000000000001e-159  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  42.46 
 
 		 859 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 864 aa  523  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  40.08 
 
 		 881 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  40.68 
 
 		 830 aa  519  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  41.88 
 
 		 834 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  42.53 
 
 		 901 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  44.16 
 
 		 858 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  40.67 
 
 		 845 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  41.04 
 
 		 908 aa  510  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  42.61 
 
 		 884 aa  510  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  41.74 
 
 		 894 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  43.96 
 
 		 914 aa  512  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  41.13 
 
 		 837 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  42.23 
 
 		 912 aa  513  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  42.66 
 
 		 901 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  42.66 
 
 		 901 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  42.66 
 
 		 901 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  43.24 
 
 		 914 aa  509  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  42.66 
 
 		 901 aa  509  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  42.61 
 
 		 901 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  42.66 
 
 		 901 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  42.66 
 
 		 901 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  42.66 
 
 		 901 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  40.3 
 
 		 907 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  42.88 
 
 		 901 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  40.85 
 
 		 908 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  40.85 
 
 		 908 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  42.35 
 
 		 897 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  40.85 
 
 		 908 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  40.93 
 
 		 908 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  39.37 
 
 		 914 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  39.37 
 
 		 914 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  41.06 
 
 		 844 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  42.41 
 
 		 833 aa  505  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  41.34 
 
 		 910 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  40.34 
 
 		 837 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  41.85 
 
 		 901 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  40.05 
 
 		 908 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>