More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2177 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  41.94 
 
 
1114 aa  787    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  46.13 
 
 
968 aa  775    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  43.32 
 
 
1113 aa  784    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  49.77 
 
 
1029 aa  864    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  42.8 
 
 
1117 aa  804    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  42.68 
 
 
916 aa  653    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 
1117 aa  2312    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  44.53 
 
 
899 aa  703    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  43.13 
 
 
910 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  41.8 
 
 
1102 aa  793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  42.74 
 
 
934 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  48.06 
 
 
1024 aa  889    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  47.14 
 
 
1017 aa  877    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  44.8 
 
 
1136 aa  832    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  41.98 
 
 
939 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  43.09 
 
 
1114 aa  806    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  46.71 
 
 
1031 aa  879    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  42.16 
 
 
1130 aa  773    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  41.26 
 
 
1116 aa  806    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  45.55 
 
 
1118 aa  747    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  42.43 
 
 
915 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 
1120 aa  809    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  42.68 
 
 
916 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  47.96 
 
 
1024 aa  883    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  47.45 
 
 
1027 aa  875    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  57.06 
 
 
1004 aa  1020    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  47.6 
 
 
1022 aa  890    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  43.76 
 
 
1118 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4504  preprotein translocase subunit SecA  41.16 
 
 
911 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626117  normal  0.321906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  40.96 
 
 
911 aa  612  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1249  preprotein translocase, SecA subunit  41.75 
 
 
904 aa  612  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  40.82 
 
 
939 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  40.61 
 
 
913 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  40.82 
 
 
911 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  40.39 
 
 
913 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  40.48 
 
 
904 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  49.44 
 
 
899 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  45.76 
 
 
894 aa  512  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  45.88 
 
 
886 aa  511  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  48.23 
 
 
897 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  51.91 
 
 
834 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  49.72 
 
 
896 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  48.88 
 
 
896 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  51.61 
 
 
837 aa  506  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  50.7 
 
 
859 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  45.96 
 
 
864 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  45.11 
 
 
857 aa  498  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  50.96 
 
 
837 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  47.02 
 
 
872 aa  499  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  47.5 
 
 
833 aa  499  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  47.93 
 
 
845 aa  495  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  50.6 
 
 
840 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  48.79 
 
 
901 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  45.11 
 
 
931 aa  495  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  47.57 
 
 
858 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  49.7 
 
 
869 aa  490  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  49.41 
 
 
868 aa  492  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  49 
 
 
830 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  43.62 
 
 
908 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  45.63 
 
 
862 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  49.49 
 
 
859 aa  488  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  49.6 
 
 
848 aa  489  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  48.38 
 
 
836 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  44.26 
 
 
862 aa  485  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  44.26 
 
 
862 aa  485  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  46.25 
 
 
844 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  49.9 
 
 
796 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  43.59 
 
 
907 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  49.49 
 
 
863 aa  484  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  47.15 
 
 
866 aa  486  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  47.33 
 
 
884 aa  485  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  43.43 
 
 
906 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  44.12 
 
 
912 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  42.93 
 
 
908 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 
835 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 
835 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  46.67 
 
 
896 aa  483  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  47.06 
 
 
992 aa  482  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  43.94 
 
 
873 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  42.98 
 
 
908 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  42.98 
 
 
908 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  48.9 
 
 
855 aa  480  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 
835 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  48.19 
 
 
835 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 
835 aa  479  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 
835 aa  479  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  42.76 
 
 
909 aa  479  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  48.19 
 
 
835 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 
835 aa  479  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  47.21 
 
 
954 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  42.81 
 
 
908 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  42.93 
 
 
906 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 
835 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  42.48 
 
 
907 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  47.52 
 
 
913 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  47.52 
 
 
916 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6305  preprotein translocase subunit SecA  46.28 
 
 
975 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  47.21 
 
 
968 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 
907 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  42.59 
 
 
908 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>