More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1274 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3555  preprotein translocase subunit SecA  48.55 
 
 
1114 aa  958    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  48.25 
 
 
1136 aa  1065    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0074  preprotein translocase subunit SecA  41.6 
 
 
968 aa  717    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  48.04 
 
 
1113 aa  1018    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  41.13 
 
 
922 aa  749    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  37.22 
 
 
917 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  47.87 
 
 
1118 aa  1013    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  37.77 
 
 
913 aa  675    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  74.93 
 
 
1031 aa  1617    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0806  preprotein translocase subunit SecA  45.76 
 
 
1116 aa  916    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.211513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  37.62 
 
 
913 aa  675    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5004  preprotein translocase subunit SecA  49.95 
 
 
1114 aa  991    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  37.5 
 
 
925 aa  668    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  46.81 
 
 
1004 aa  899    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  71.65 
 
 
1024 aa  1563    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  69.9 
 
 
1017 aa  1517    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0623  preprotein translocase, SecA subunit  42.35 
 
 
867 aa  716    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  38.79 
 
 
920 aa  707    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  72.11 
 
 
1027 aa  1558    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
1029 aa  2114    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  73.66 
 
 
1024 aa  1603    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  39.36 
 
 
916 aa  681    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0823  preprotein translocase, SecA subunit  38.08 
 
 
1010 aa  681    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.449407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0657  preprotein translocase, SecA subunit  38.89 
 
 
1024 aa  694    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0383257  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0465  preprotein translocase subunit SecA  47.82 
 
 
1120 aa  968    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  49.06 
 
 
1102 aa  1033    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3607  preprotein translocase, SecA subunit  40.18 
 
 
890 aa  648    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0128  preprotein translocase subunit SecA  48.6 
 
 
1118 aa  989    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0813165 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2177  preprotein translocase, SecA subunit  46.09 
 
 
1117 aa  872    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4938  preprotein translocase, SecA subunit  48.31 
 
 
1130 aa  952    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000192031  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  72.59 
 
 
1022 aa  1556    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09101  translocase  48.03 
 
 
1117 aa  972    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  39.4 
 
 
906 aa  702    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  46.72 
 
 
859 aa  595  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  35.56 
 
 
992 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  46.79 
 
 
864 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  47.31 
 
 
834 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  49.21 
 
 
894 aa  569  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  44.25 
 
 
836 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  48.76 
 
 
845 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  46.33 
 
 
886 aa  565  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 
835 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 
835 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  46.33 
 
 
848 aa  557  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  43.68 
 
 
835 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 
835 aa  555  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  43.68 
 
 
835 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  43.68 
 
 
835 aa  555  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  47.6 
 
 
896 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 
835 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  46.29 
 
 
830 aa  555  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  43.82 
 
 
835 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  43.68 
 
 
835 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  45.4 
 
 
900 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  44.96 
 
 
837 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  43.22 
 
 
896 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  44.23 
 
 
837 aa  549  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 
897 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  44.82 
 
 
858 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  48.7 
 
 
925 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  44.22 
 
 
908 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  46.38 
 
 
844 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  44.91 
 
 
910 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  47.31 
 
 
903 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  44.44 
 
 
840 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  44.96 
 
 
897 aa  544  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  47.29 
 
 
833 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  48.95 
 
 
884 aa  544  1e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  47.92 
 
 
899 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  44.83 
 
 
907 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  44.91 
 
 
916 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  45.28 
 
 
845 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  45.53 
 
 
838 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  49.66 
 
 
858 aa  542  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  42.82 
 
 
835 aa  539  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  44.61 
 
 
904 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 
901 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  45.28 
 
 
840 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  44.46 
 
 
907 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  44.61 
 
 
904 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  43.27 
 
 
881 aa  536  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  47.31 
 
 
899 aa  539  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  44.61 
 
 
904 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  45.17 
 
 
836 aa  536  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  49.75 
 
 
869 aa  535  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  47.94 
 
 
862 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  47.94 
 
 
862 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  46.41 
 
 
908 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  49.83 
 
 
868 aa  533  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 
910 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  43.71 
 
 
907 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  44.31 
 
 
907 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  44.53 
 
 
901 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  44.09 
 
 
901 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  41.76 
 
 
944 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  44.22 
 
 
912 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  48.84 
 
 
863 aa  531  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  48.03 
 
 
862 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  46.6 
 
 
908 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  44.33 
 
 
901 aa  532  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>