More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3195 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00099  translocase  51.44 
 
 
901 aa  873    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  51.44 
 
 
901 aa  873    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  51.63 
 
 
897 aa  876    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  48.35 
 
 
911 aa  820    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  48.03 
 
 
922 aa  795    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  61.82 
 
 
844 aa  1088    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  49.41 
 
 
842 aa  789    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  46.29 
 
 
868 aa  764    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  49.2 
 
 
934 aa  844    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  74.94 
 
 
835 aa  1318    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  51.29 
 
 
893 aa  873    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  49.07 
 
 
862 aa  806    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1687  preprotein translocase subunit SecA  57.9 
 
 
842 aa  975    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  48.72 
 
 
906 aa  797    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  49.28 
 
 
908 aa  861    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  48.79 
 
 
913 aa  818    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0838  preprotein translocase subunit SecA  49.62 
 
 
788 aa  764    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  74.58 
 
 
835 aa  1313    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0784  preprotein translocase subunit SecA  48.4 
 
 
787 aa  751    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  74.7 
 
 
835 aa  1315    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0786  preprotein translocase subunit SecA  49.62 
 
 
788 aa  764    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  74.7 
 
 
835 aa  1317    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  49.09 
 
 
931 aa  848    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  50.06 
 
 
896 aa  863    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  50.28 
 
 
896 aa  864    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  48.74 
 
 
913 aa  825    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0248  preprotein translocase subunit SecA  45.91 
 
 
929 aa  767    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  50.39 
 
 
904 aa  858    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  52.09 
 
 
968 aa  831    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  49.24 
 
 
924 aa  853    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  45.12 
 
 
862 aa  747    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  51.44 
 
 
923 aa  841    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  49.09 
 
 
931 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  51.56 
 
 
903 aa  879    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  49.84 
 
 
934 aa  826    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  47.57 
 
 
908 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  50.73 
 
 
896 aa  867    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  48.61 
 
 
932 aa  846    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  51.63 
 
 
899 aa  885    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  52.87 
 
 
864 aa  901    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  48.95 
 
 
910 aa  844    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0882  preprotein translocase subunit SecA  49.62 
 
 
788 aa  764    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  74.58 
 
 
835 aa  1313    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  49.82 
 
 
857 aa  825    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  49.67 
 
 
917 aa  848    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0045  preprotein translocase subunit SecA  49.41 
 
 
944 aa  757    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  49 
 
 
896 aa  797    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  57 
 
 
896 aa  1020    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  49.25 
 
 
930 aa  850    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  46.65 
 
 
962 aa  809    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  50.54 
 
 
994 aa  781    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  46.76 
 
 
911 aa  807    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  45.27 
 
 
862 aa  753    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0289  preprotein translocase subunit SecA  46.09 
 
 
903 aa  762    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.703701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  49.62 
 
 
921 aa  857    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  47.82 
 
 
917 aa  812    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  50.39 
 
 
908 aa  858    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  49.73 
 
 
921 aa  862    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  47.77 
 
 
936 aa  832    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  49.01 
 
 
907 aa  860    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  49.34 
 
 
912 aa  837    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  45.64 
 
 
951 aa  781    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0274  preprotein translocase subunit SecA  45.68 
 
 
926 aa  767    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  49.89 
 
 
930 aa  863    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  46.83 
 
 
895 aa  781    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  46.59 
 
 
911 aa  798    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  48.5 
 
 
932 aa  845    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  50.18 
 
 
947 aa  773    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  51.98 
 
 
902 aa  862    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  50.66 
 
 
909 aa  870    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  48.63 
 
 
910 aa  816    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  60.31 
 
 
840 aa  1022    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  60.36 
 
 
845 aa  1025    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  48.65 
 
 
898 aa  815    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 
908 aa  858    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  49.28 
 
 
908 aa  861    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  51.38 
 
 
909 aa  875    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 
906 aa  864    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  57.67 
 
 
830 aa  999    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  44.63 
 
 
955 aa  781    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  48.7 
 
 
931 aa  848    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  48.2 
 
 
916 aa  830    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  57.66 
 
 
865 aa  988    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1321  protein translocase subunit secA  57.67 
 
 
788 aa  924    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  61.67 
 
 
799 aa  1001    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0183  protein translocase subunit secA  57.23 
 
 
803 aa  915    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  58.64 
 
 
849 aa  990    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2706  preprotein translocase subunit SecA  50.18 
 
 
912 aa  755    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0684143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  48.5 
 
 
932 aa  846    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  55.54 
 
 
840 aa  917    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  50.5 
 
 
901 aa  874    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 
908 aa  859    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  52.91 
 
 
1009 aa  808    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  49.18 
 
 
855 aa  811    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  49.66 
 
 
896 aa  842    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  48.62 
 
 
901 aa  781    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  48.38 
 
 
937 aa  801    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  49.83 
 
 
908 aa  870    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1371  preprotein translocase subunit SecA  50.18 
 
 
947 aa  773    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.719275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  50.22 
 
 
906 aa  868    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>