More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0342 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 276 aa  552  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 276 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  74.9 
 
 		 281 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  70.25 
 
 		 314 aa  377  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  74.53 
 
 		 278 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  60.22 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  56.68 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  55.8 
 
 		 272 aa  318  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  55.44 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  34.6 
 
 		 222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  29.64 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  28.51 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  24.91 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  26.85 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  26.85 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  28.68 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  28.63 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  28.35 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  28.63 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  28.35 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  27.72 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  27.97 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  27.97 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  27.97 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  27.97 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  27.97 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  74.19 
 
 		 897 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  28.14 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  25.97 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  73.33 
 
 		 845 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  71.88 
 
 		 848 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  26.36 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  26.36 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  26.36 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  26.36 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  70.59 
 
 		 896 aa  59.3  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  26.79 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  27.72 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  70.59 
 
 		 944 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  25.75 
 
 		 432 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  26.42 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  70.59 
 
 		 962 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  70.59 
 
 		 962 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 1136 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  41.86 
 
 		 835 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  70.59 
 
 		 962 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  41.86 
 
 		 835 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  69.44 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  41.86 
 
 		 835 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  40.7 
 
 		 835 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 844 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  40.7 
 
 		 835 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  40.7 
 
 		 835 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  40.7 
 
 		 835 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  26.69 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  40.7 
 
 		 835 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  40.7 
 
 		 835 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  88 
 
 		 834 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  77.78 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 888 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  40.7 
 
 		 835 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  41.86 
 
 		 836 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  88.46 
 
 		 1031 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  27.9 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 1029 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 921 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 866 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  29.73 
 
 		 1200 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  76.92 
 
 		 593 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  68.97 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 837 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  49.15 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  73.53 
 
 		 836 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 907 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  77.78 
 
 		 166 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 912 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  41.67 
 
 		 800 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  80.77 
 
 		 844 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  54.76 
 
 		 535 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 872 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 864 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 909 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 162 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 842 aa  53.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  63.64 
 
 		 225 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 908 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 858 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 933 aa  52.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 881 aa  52.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 906 aa  52.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  42.5 
 
 		 164 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 907 aa  52.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 378 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  72.41 
 
 		 164 aa  52.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1118 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  73.08 
 
 		 618 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  39.18 
 
 		 160 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 855 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  31.21 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>