More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0915 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 112 aa  233  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  70.54 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  71.17 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  69.37 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  68.47 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  68.47 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  68.47 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  59.46 
 
 		 111 aa  140  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  56.76 
 
 		 111 aa  139  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  56.76 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  58.33 
 
 		 110 aa  137  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  54.63 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  51.35 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  54.95 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  49.14 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  46.3 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  46.3 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 1017 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  36.19 
 
 		 894 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  39.24 
 
 		 896 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  40.24 
 
 		 1027 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  32.43 
 
 		 962 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  32.43 
 
 		 962 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  32.43 
 
 		 962 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  33.33 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  41.67 
 
 		 897 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  72.41 
 
 		 848 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  32.71 
 
 		 836 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  32.43 
 
 		 944 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 1031 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 888 aa  50.4  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 872 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  67.74 
 
 		 272 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 276 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  56.82 
 
 		 260 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 866 aa  50.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  29.91 
 
 		 915 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 276 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  66.67 
 
 		 432 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  86.96 
 
 		 259 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 844 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  90.48 
 
 		 283 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  63.33 
 
 		 845 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  86.36 
 
 		 420 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  42.19 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  61.29 
 
 		 921 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  38.16 
 
 		 1024 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 384 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  75 
 
 		 231 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  31.58 
 
 		 910 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  94.74 
 
 		 834 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  56.1 
 
 		 855 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  64.71 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 921 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  32.38 
 
 		 896 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 864 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  28.97 
 
 		 869 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 957 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 833 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  90 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  33.33 
 
 		 859 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 912 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 910 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  71.43 
 
 		 830 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  68 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 858 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  81.82 
 
 		 618 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  31.53 
 
 		 917 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  56.1 
 
 		 535 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 838 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 837 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  32.38 
 
 		 901 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  52.38 
 
 		 958 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 836 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  29.66 
 
 		 922 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  72 
 
 		 318 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  66.67 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  54.84 
 
 		 309 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 		 1200 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  81.82 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  34.25 
 
 		 922 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  44.07 
 
 		 319 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 1024 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 910 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  34.38 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  51.16 
 
 		 800 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  63.33 
 
 		 1136 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  25 
 
 		 933 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  60 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 1022 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 912 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>