More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1324 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 111 aa  230  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  81.08 
 
 		 111 aa  193  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  71.17 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  70.27 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  70.27 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  70.27 
 
 		 112 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  70.27 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 111 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  64.81 
 
 		 110 aa  150  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  59.46 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  56.76 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  54.21 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  52.78 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  50.93 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  60.36 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  49.07 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  47.37 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  84 
 
 		 855 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  60.98 
 
 		 888 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  35.37 
 
 		 1027 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  52.17 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  44.83 
 
 		 838 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  66.67 
 
 		 432 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  38.46 
 
 		 897 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 896 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 912 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  45.21 
 
 		 906 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  41.54 
 
 		 912 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  62.86 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 896 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  33.64 
 
 		 962 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  33.64 
 
 		 962 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  43.84 
 
 		 896 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  36.62 
 
 		 903 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  33.64 
 
 		 962 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 909 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  61.29 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 272 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  40.85 
 
 		 836 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  32.73 
 
 		 944 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  67.86 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 894 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 844 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 1031 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  66.67 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  59.46 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  70 
 
 		 419 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  43.4 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 260 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  63.33 
 
 		 859 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 866 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  43.4 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  39.71 
 
 		 939 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  47.46 
 
 		 848 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  40.74 
 
 		 922 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  62.16 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 1017 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  77.27 
 
 		 800 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 872 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  43.84 
 
 		 896 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  60 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  45.83 
 
 		 384 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 864 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 845 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  73.33 
 
 		 239 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  40.3 
 
 		 910 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  62.96 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 836 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  85 
 
 		 259 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 957 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  62.96 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 958 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 535 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  40.68 
 
 		 1136 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  40.3 
 
 		 903 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  62.96 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  41.43 
 
 		 910 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  30.21 
 
 		 869 aa  47  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  45.1 
 
 		 1113 aa  46.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  36.62 
 
 		 837 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 859 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  41.27 
 
 		 309 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  34.72 
 
 		 1029 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  69.23 
 
 		 235 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  77.27 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 858 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  80.95 
 
 		 420 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  51.28 
 
 		 834 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  61.29 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  66.67 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  46.3 
 
 		 858 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  41.51 
 
 		 278 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  76.19 
 
 		 921 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>