More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0617 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  100 
 
 		 264 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  26.89 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  25.32 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  26.03 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  53.06 
 
 		 837 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  40.66 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  24.6 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  60.98 
 
 		 858 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  65.79 
 
 		 896 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  24.8 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  56.25 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 888 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 		 836 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  58.14 
 
 		 864 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  37.84 
 
 		 869 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  52 
 
 		 897 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  54.17 
 
 		 848 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  24.24 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  24.24 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  44.26 
 
 		 1113 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  54.17 
 
 		 897 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 958 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  35.44 
 
 		 894 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  64.71 
 
 		 160 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 838 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 1031 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  56.1 
 
 		 912 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  62.16 
 
 		 844 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  58.14 
 
 		 921 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  40.24 
 
 		 903 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 910 aa  53.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  63.89 
 
 		 896 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  46.43 
 
 		 1136 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  46.94 
 
 		 837 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  76 
 
 		 800 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  43.75 
 
 		 962 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  43.75 
 
 		 962 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  74.19 
 
 		 419 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  41.67 
 
 		 944 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  43.75 
 
 		 962 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  52.38 
 
 		 866 aa  53.5  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 909 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  38.14 
 
 		 845 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 957 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 910 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  48.94 
 
 		 922 aa  52.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 1200 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 834 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  35.05 
 
 		 918 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  85.71 
 
 		 384 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  46.38 
 
 		 833 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  38.96 
 
 		 912 aa  52  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  22.69 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 881 aa  52  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 901 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  69.23 
 
 		 909 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 872 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 915 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  34.65 
 
 		 922 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  35.71 
 
 		 859 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 844 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 900 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  58.33 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  50.85 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  68.75 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  58.33 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  81.82 
 
 		 830 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  64.52 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  58.33 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  58.33 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  51.11 
 
 		 1067 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  51.16 
 
 		 921 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  58.33 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 931 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 904 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  52.5 
 
 		 939 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 931 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  77.27 
 
 		 618 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 919 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 917 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 931 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  60.61 
 
 		 936 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 930 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  54 
 
 		 921 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 932 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 904 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  75.86 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  48.89 
 
 		 936 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  85.71 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 931 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 932 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 904 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 931 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 916 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  90.48 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  65.71 
 
 		 921 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 917 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 931 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 932 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>