More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2706 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  100 
 
 		 232 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  100 
 
 		 232 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  62.29 
 
 		 236 aa  308  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  31.6 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  31.6 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  32.42 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  31.58 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  33.19 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  32.84 
 
 		 201 aa  91.7  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  32.79 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  30.36 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  34.36 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  31.58 
 
 		 432 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  29.13 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  27.76 
 
 		 283 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  27.73 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  30.49 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  27.73 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  29.15 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  35.19 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  26.96 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  26.09 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  26.96 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  26.47 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  26.09 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  26.09 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  26.09 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  26.09 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  26.09 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  25.91 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  28.44 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  25.65 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  24.79 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  26.47 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  26.47 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  28.02 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  24.67 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  31.52 
 
 		 204 aa  72  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  28.63 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  26 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  29.41 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  26.09 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  30.05 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  24.89 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  25.79 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  25.79 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  28.27 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  28.28 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  28.28 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  34.85 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  78.12 
 
 		 881 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  25.66 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  84.62 
 
 		 912 aa  58.9  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  26.35 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 907 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  29.33 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  30.89 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  24.34 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  67.74 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 933 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 908 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 864 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 909 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  34.09 
 
 		 183 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4251  yecA family protein  33.83 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.882611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 910 aa  55.8  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  56.41 
 
 		 844 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 908 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 908 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 908 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  55 
 
 		 922 aa  55.1  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 908 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 907 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 908 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 872 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 911 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 908 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 907 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 1004 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  51.02 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 917 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 834 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 833 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 838 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  25.91 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 836 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  86.36 
 
 		 921 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 162 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  51.16 
 
 		 830 aa  52.4  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  51.22 
 
 		 618 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 896 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  57.5 
 
 		 384 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  30.53 
 
 		 184 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 921 aa  51.6  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 837 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>