More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2368 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00099  translocase  50.83 
 
 		 901 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  50.83 
 
 		 901 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  51.79 
 
 		 931 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  51.28 
 
 		 897 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 911 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  50.6 
 
 		 947 aa  653    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  48.21 
 
 		 918 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  50.44 
 
 		 868 aa  666    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  51.54 
 
 		 934 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  51.79 
 
 		 931 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  47.59 
 
 		 893 aa  653    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  50.15 
 
 		 862 aa  666    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  52.06 
 
 		 906 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  49.44 
 
 		 908 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  47.09 
 
 		 913 aa  682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  51.79 
 
 		 931 aa  683    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0361  preprotein translocase subunit SecA  49.71 
 
 		 910 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.746169  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  49.64 
 
 		 933 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  51.79 
 
 		 931 aa  683    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  47.86 
 
 		 896 aa  671    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  47.86 
 
 		 896 aa  671    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  46.84 
 
 		 913 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  49.58 
 
 		 907 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  50.14 
 
 		 904 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  51.66 
 
 		 968 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  49.93 
 
 		 924 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  50.52 
 
 		 862 aa  650    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  50.22 
 
 		 923 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  49.32 
 
 		 917 aa  675    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  51.79 
 
 		 931 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  48.04 
 
 		 903 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  46.71 
 
 		 934 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  50.22 
 
 		 908 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  51.44 
 
 		 896 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  51.43 
 
 		 932 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  51.28 
 
 		 899 aa  737    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  51.17 
 
 		 864 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  49.24 
 
 		 910 aa  668    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  50.44 
 
 		 862 aa  667    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  48.91 
 
 		 857 aa  660    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  50.15 
 
 		 917 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  44.84 
 
 		 896 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  50.39 
 
 		 896 aa  727    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  51.71 
 
 		 930 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  49.93 
 
 		 962 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  51.78 
 
 		 994 aa  702    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  49.44 
 
 		 908 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  51.45 
 
 		 911 aa  672    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  48.83 
 
 		 971 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  46 
 
 		 862 aa  654    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  54.67 
 
 		 873 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  50.07 
 
 		 921 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  46.92 
 
 		 917 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  51.79 
 
 		 931 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  51.47 
 
 		 908 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  47.97 
 
 		 921 aa  660    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  51.51 
 
 		 936 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  49.46 
 
 		 907 aa  665    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  50.57 
 
 		 917 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  50.95 
 
 		 912 aa  707    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  47.38 
 
 		 921 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4705  preprotein translocase subunit SecA  47.5 
 
 		 933 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00981811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  49.46 
 
 		 930 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  46.82 
 
 		 993 aa  693    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  47.52 
 
 		 895 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  50.28 
 
 		 911 aa  679    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  51.44 
 
 		 932 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  48.43 
 
 		 947 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  49.07 
 
 		 902 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  51.09 
 
 		 909 aa  670    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  51.4 
 
 		 910 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  50.88 
 
 		 840 aa  682    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  50.22 
 
 		 845 aa  681    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  50.22 
 
 		 908 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  49.31 
 
 		 908 aa  666    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  49.31 
 
 		 908 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  48.59 
 
 		 909 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  47.31 
 
 		 906 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  49.85 
 
 		 830 aa  655    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  45.22 
 
 		 910 aa  710    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  51 
 
 		 931 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  50.07 
 
 		 916 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1387  preprotein translocase subunit SecA  47.58 
 
 		 947 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.606945  normal  0.598179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2706  preprotein translocase subunit SecA  52.79 
 
 		 912 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0684143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  51.44 
 
 		 932 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  48.88 
 
 		 840 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  51.68 
 
 		 901 aa  674    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  49.31 
 
 		 908 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  52.49 
 
 		 1009 aa  700    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  46.42 
 
 		 855 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  50.41 
 
 		 896 aa  708    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  51.79 
 
 		 931 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  48.07 
 
 		 937 aa  672    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  48.03 
 
 		 908 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1371  preprotein translocase subunit SecA  48.43 
 
 		 947 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.719275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  47.8 
 
 		 906 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  47.96 
 
 		 921 aa  666    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1762  preprotein translocase subunit SecA  47.94 
 
 		 938 aa  644    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  47.82 
 
 		 912 aa  680    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  51.02 
 
 		 833 aa  685    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>