More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1863 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 800 aa  1633    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 931 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 931 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  91.3 
 
 		 848 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  34.53 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 866 aa  57  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 838 aa  57.4  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  55.32 
 
 		 535 aa  57.4  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 910 aa  57.4  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 888 aa  57.4  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  55.56 
 
 		 384 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  34.09 
 
 		 291 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  95.45 
 
 		 257 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 		 160 aa  55.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 897 aa  56.2  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 		 135 aa  55.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 1200 aa  56.2  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  64.71 
 
 		 917 aa  55.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  34.85 
 
 		 291 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  35.71 
 
 		 932 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  35.71 
 
 		 932 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  35.71 
 
 		 932 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  67.65 
 
 		 228 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 842 aa  55.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 896 aa  55.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 896 aa  55.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  69.7 
 
 		 162 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  30.19 
 
 		 168 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 894 aa  55.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  67.74 
 
 		 228 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  30.19 
 
 		 168 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 932 aa  55.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 1136 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 864 aa  55.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 844 aa  55.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  30.19 
 
 		 168 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  87.5 
 
 		 980 aa  55.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 834 aa  55.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 836 aa  54.7  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  67.74 
 
 		 239 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  30.19 
 
 		 168 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 912 aa  54.7  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 922 aa  54.7  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  78.26 
 
 		 909 aa  54.7  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 858 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 419 aa  54.3  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  64.71 
 
 		 61 aa  54.3  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 881 aa  53.5  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  42.86 
 
 		 859 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  82.61 
 
 		 166 aa  53.5  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  59.46 
 
 		 296 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 932 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  57.89 
 
 		 907 aa  53.9  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 958 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  31.9 
 
 		 618 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  30.19 
 
 		 168 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 957 aa  53.9  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  82.61 
 
 		 593 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 921 aa  53.5  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  43.33 
 
 		 152 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 1031 aa  53.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  90.48 
 
 		 237 aa  53.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 934 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 909 aa  53.5  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  86.36 
 
 		 421 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  90.48 
 
 		 267 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  90.48 
 
 		 170 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 872 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  48.94 
 
 		 857 aa  53.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 930 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  41.67 
 
 		 276 aa  53.5  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  61.11 
 
 		 906 aa  53.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  82.61 
 
 		 830 aa  53.5  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  76 
 
 		 264 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  63.89 
 
 		 160 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  43.33 
 
 		 159 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 837 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  64.52 
 
 		 253 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 		 164 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  41.67 
 
 		 276 aa  53.5  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 908 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 900 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 		 164 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  61.76 
 
 		 908 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 908 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 907 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 934 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>