More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5550 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  48.94 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  46.81 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  46.45 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  45.49 
 
 		 293 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  74.19 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 834 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  70.97 
 
 		 945 aa  57.4  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  79.17 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  86.96 
 
 		 920 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 1200 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002976  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  75 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  34.04 
 
 		 865 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  67.86 
 
 		 731 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  21.84 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 888 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1216  SEC-C domain-containing protein  76.92 
 
 		 70 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 896 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 866 aa  53.5  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  59.46 
 
 		 800 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 848 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 864 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  95 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  35.29 
 
 		 844 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  86.96 
 
 		 916 aa  53.1  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4346  hypothetical protein  76.92 
 
 		 58 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 837 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  81.82 
 
 		 731 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1416  SecC motif-containing protein  76.92 
 
 		 63 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.262728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50950  hypothetical protein  76.92 
 
 		 66 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  hitchhiker  0.0000141256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0625  SecA, C-motif-containing protein  70.83 
 
 		 209 aa  52.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 1277 aa  52.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  80.95 
 
 		 909 aa  52.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4299  SecC motif-containing protein  76.92 
 
 		 65 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  86.36 
 
 		 378 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  61.76 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1138  SecC motif-containing protein  76.92 
 
 		 67 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.556263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  61.76 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3870  SecC motif-containing protein  76.92 
 
 		 66 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.44355 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  38.1 
 
 		 167 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  34.88 
 
 		 902 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  61.76 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  61.76 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  37.84 
 
 		 858 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 838 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  90.48 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 836 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  61.76 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  72.73 
 
 		 585 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1114  SEC-C domain-containing protein  73.08 
 
 		 65 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1153  SecC motif-containing protein  73.08 
 
 		 65 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  64.29 
 
 		 881 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 859 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  85.71 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 421 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 897 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 912 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  36.36 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 842 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 872 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  69.23 
 
 		 104 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 896 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  94.74 
 
 		 535 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  57.89 
 
 		 1004 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  63.64 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  80.77 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  84.21 
 
 		 1136 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 		 1113 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 837 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  94.44 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  55.56 
 
 		 593 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  41.07 
 
 		 992 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  76.19 
 
 		 830 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  59.46 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  89.47 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  94.74 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2451  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  94.74 
 
 		 222 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  76.19 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  56.41 
 
 		 958 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 901 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  89.47 
 
 		 135 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  80.95 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 957 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  94.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  94.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  94.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  94.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  94.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  94.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  85.71 
 
 		 432 aa  49.3  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  94.44 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  94.74 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  94.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  94.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  94.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 845 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  32.54 
 
 		 160 aa  49.3  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  41.18 
 
 		 618 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1519  SecC motif-containing protein  85 
 
 		 488 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67332  normal  0.0279077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>