More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02932 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002976  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  81.68 
 
 		 205 aa  352  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0625  SecA, C-motif-containing protein  55.34 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0113543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2150  hypothetical protein  53.3 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  49.18 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  49.18 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 916 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  27.59 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  67.74 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  79.17 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  28.29 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  28.29 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  28.29 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  32.5 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 910 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  28.29 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  37.35 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  37.76 
 
 		 908 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 1200 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  58.97 
 
 		 864 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 894 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 837 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  68.97 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  68.75 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  40.79 
 
 		 535 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 912 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 836 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  72 
 
 		 945 aa  52  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  48.89 
 
 		 930 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 936 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  61.11 
 
 		 421 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 866 aa  51.6  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  52.5 
 
 		 908 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  52.5 
 
 		 908 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 838 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 924 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  46.81 
 
 		 958 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 930 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  52.5 
 
 		 908 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  58.97 
 
 		 909 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 865 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 922 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 384 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  27.59 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 934 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  27.59 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 934 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 834 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  27.59 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  27.59 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 923 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  35.23 
 
 		 267 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 932 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  36.17 
 
 		 909 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  56.76 
 
 		 904 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  61.29 
 
 		 920 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 936 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 907 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 1118 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 932 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 932 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 931 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 932 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 936 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 908 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 907 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 934 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  56.76 
 
 		 904 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  56.76 
 
 		 904 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  27.59 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  73.91 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 1113 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  35.23 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  43.1 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 902 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 897 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 907 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 917 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 910 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 1031 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  51.52 
 
 		 283 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  36.94 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 957 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50950  hypothetical protein  76 
 
 		 66 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  hitchhiker  0.0000141256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 908 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 911 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  68.97 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  73.91 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 888 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  94.74 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 901 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>