More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2150 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2150  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  54.41 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002976  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  51.96 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0625  SecA, C-motif-containing protein  48.79 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0113543  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  55.1 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  75.86 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  70.97 
 
 		 945 aa  56.2  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  75.86 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  57.89 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  40.96 
 
 		 166 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  80 
 
 		 920 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  76.92 
 
 		 916 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  53.49 
 
 		 872 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  32.23 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  74.07 
 
 		 384 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  73.08 
 
 		 1200 aa  51.2  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  47.92 
 
 		 912 aa  51.6  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  65.52 
 
 		 838 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  27.78 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 896 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  57.58 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  62.5 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 897 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  41.27 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  39.19 
 
 		 135 aa  48.9  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2000  preprotein translocase, SecA subunit  56.25 
 
 		 934 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 910 aa  48.5  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  56.67 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 864 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  70.83 
 
 		 865 aa  48.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 888 aa  48.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  30.33 
 
 		 260 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  59.38 
 
 		 834 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 894 aa  48.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 866 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 957 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  55.88 
 
 		 836 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  63.33 
 
 		 535 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 837 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  72.73 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  26.78 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  68 
 
 		 618 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  27.38 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  34.94 
 
 		 859 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  73.91 
 
 		 830 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 958 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  45.45 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  27.38 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  77.27 
 
 		 253 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4346  hypothetical protein  76 
 
 		 58 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 922 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  72.73 
 
 		 421 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  48.78 
 
 		 930 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 896 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  24.2 
 
 		 432 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  56.25 
 
 		 857 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  36.36 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  42.31 
 
 		 858 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  36.36 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  62.07 
 
 		 901 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 833 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  77.27 
 
 		 1277 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  80 
 
 		 921 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  52.94 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 848 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  32.93 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 1031 aa  46.2  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50950  hypothetical protein  76 
 
 		 66 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  hitchhiker  0.0000141256 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  67.86 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  69.57 
 
 		 800 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 917 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  73.91 
 
 		 419 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 837 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  80.95 
 
 		 930 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  29.82 
 
 		 906 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  25.12 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  66.67 
 
 		 937 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  47.62 
 
 		 933 aa  45.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  25.12 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  25.12 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 897 aa  45.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  29.79 
 
 		 916 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  29.79 
 
 		 913 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  58.06 
 
 		 1136 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  76.19 
 
 		 457 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 897 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  69.57 
 
 		 909 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3831  preprotein translocase subunit SecA  30.88 
 
 		 905 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 962 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  76.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  65.38 
 
 		 962 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 962 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  62.07 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  30.65 
 
 		 278 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  28.97 
 
 		 281 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  80.95 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>