More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1290 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00099  translocase  46.82 
 
 		 901 aa  792    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  46.82 
 
 		 901 aa  792    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  47.69 
 
 		 897 aa  822    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  45.02 
 
 		 911 aa  771    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  43.95 
 
 		 922 aa  754    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  44.29 
 
 		 844 aa  764    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  47.53 
 
 		 842 aa  761    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  46.97 
 
 		 868 aa  780    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  47.16 
 
 		 934 aa  819    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  47.71 
 
 		 835 aa  817    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  45.85 
 
 		 893 aa  790    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  45.15 
 
 		 862 aa  767    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  47.36 
 
 		 906 aa  790    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  46.33 
 
 		 908 aa  800    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  44.21 
 
 		 913 aa  753    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  47.82 
 
 		 835 aa  816    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  47.82 
 
 		 835 aa  816    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  47.82 
 
 		 835 aa  816    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  47.46 
 
 		 931 aa  814    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  47.76 
 
 		 896 aa  826    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  47.76 
 
 		 896 aa  825    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  45.13 
 
 		 913 aa  760    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0248  preprotein translocase subunit SecA  45.74 
 
 		 929 aa  781    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  46.98 
 
 		 904 aa  820    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  50.21 
 
 		 968 aa  932    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  46.98 
 
 		 924 aa  814    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  44.69 
 
 		 862 aa  741    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  46.5 
 
 		 923 aa  771    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  45.76 
 
 		 953 aa  785    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  47.46 
 
 		 931 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  46.77 
 
 		 903 aa  819    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  44.34 
 
 		 934 aa  755    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  46.7 
 
 		 908 aa  790    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  49.04 
 
 		 896 aa  842    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  47.3 
 
 		 932 aa  811    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  48.59 
 
 		 899 aa  832    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  44.87 
 
 		 864 aa  776    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  46.38 
 
 		 910 aa  781    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  47.82 
 
 		 835 aa  816    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  45.7 
 
 		 857 aa  749    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  47.26 
 
 		 917 aa  834    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  47.13 
 
 		 896 aa  776    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  51.94 
 
 		 896 aa  924    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  47.3 
 
 		 930 aa  813    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  47.19 
 
 		 962 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  54.75 
 
 		 994 aa  875    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  46.18 
 
 		 946 aa  778    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  47.72 
 
 		 911 aa  814    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  45.22 
 
 		 862 aa  738    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0289  preprotein translocase subunit SecA  45.02 
 
 		 903 aa  741    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.703701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  48.36 
 
 		 921 aa  830    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  46.94 
 
 		 917 aa  796    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  46.46 
 
 		 947 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  47.98 
 
 		 908 aa  835    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  48.14 
 
 		 921 aa  833    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  46.15 
 
 		 936 aa  797    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  45.92 
 
 		 907 aa  787    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0299  preprotein translocase subunit SecA  45.79 
 
 		 946 aa  779    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  47.07 
 
 		 912 aa  810    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  46.94 
 
 		 951 aa  792    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0274  preprotein translocase subunit SecA  45.57 
 
 		 926 aa  782    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  47.78 
 
 		 930 aa  824    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  45.63 
 
 		 993 aa  795    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  46.32 
 
 		 895 aa  776    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  46.51 
 
 		 911 aa  808    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  46.77 
 
 		 932 aa  811    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  53.2 
 
 		 947 aa  857    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  52.04 
 
 		 902 aa  884    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  46.17 
 
 		 909 aa  781    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  47.99 
 
 		 910 aa  804    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  47.67 
 
 		 840 aa  825    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  47.56 
 
 		 845 aa  825    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  44.67 
 
 		 898 aa  744    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  46.17 
 
 		 908 aa  796    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  46.28 
 
 		 908 aa  798    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  48.12 
 
 		 909 aa  804    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  45.19 
 
 		 906 aa  772    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  48.92 
 
 		 830 aa  873    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  43.64 
 
 		 955 aa  775    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  47.35 
 
 		 931 aa  818    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  45.33 
 
 		 916 aa  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  47.7 
 
 		 799 aa  740    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  44.78 
 
 		 849 aa  759    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2706  preprotein translocase subunit SecA  51.95 
 
 		 912 aa  833    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0684143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  46.77 
 
 		 932 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  48.35 
 
 		 840 aa  824    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  47.66 
 
 		 901 aa  805    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  46.26 
 
 		 908 aa  796    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  52.07 
 
 		 1009 aa  880    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  47.14 
 
 		 896 aa  810    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  45.45 
 
 		 901 aa  753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  52.3 
 
 		 937 aa  896    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  46.96 
 
 		 908 aa  798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1371  preprotein translocase subunit SecA  53.2 
 
 		 947 aa  857    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.719275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  46.18 
 
 		 906 aa  788    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1598  preprotein translocase, SecA subunit  48.43 
 
 		 850 aa  769    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1762  preprotein translocase subunit SecA  50.83 
 
 		 938 aa  826    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  47.75 
 
 		 912 aa  809    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  46.41 
 
 		 833 aa  784    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  48.73 
 
 		 922 aa  850    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>