295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0625 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0625  SecA, C-motif-containing protein  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002976  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  60.68 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02932  hypothetical protein  55.34 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2150  hypothetical protein  48 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  41.56 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  72 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  30.97 
 
 		 849 aa  52.8  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  70.83 
 
 		 296 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  25 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  33.63 
 
 		 902 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  24.54 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 896 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  31.63 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  30.51 
 
 		 901 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  55.88 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  34.12 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 618 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 1200 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 897 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  31.34 
 
 		 432 aa  48.5  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  35.44 
 
 		 939 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  65.38 
 
 		 909 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1687  preprotein translocase subunit SecA  28.57 
 
 		 842 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  55 
 
 		 1031 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  85 
 
 		 421 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 888 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  62.96 
 
 		 384 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 894 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  48.98 
 
 		 135 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  32.99 
 
 		 900 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  35.44 
 
 		 937 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  59.26 
 
 		 912 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  27.45 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 922 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  27.45 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  27.19 
 
 		 909 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  51.35 
 
 		 896 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 864 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  27.34 
 
 		 910 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  58.06 
 
 		 916 aa  47.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  26.96 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  55.56 
 
 		 908 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  27.45 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  32.26 
 
 		 907 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  77.27 
 
 		 866 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  58.06 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  59.38 
 
 		 830 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  38.46 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  33 
 
 		 916 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  80.95 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  27.62 
 
 		 907 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 1017 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  28.21 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 921 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 936 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  51.52 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  65.52 
 
 		 901 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  66.67 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  51.52 
 
 		 276 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 535 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 836 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  34.34 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50950  hypothetical protein  68 
 
 		 66 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  hitchhiker  0.0000141256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  41.51 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  61.29 
 
 		 1136 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  52.5 
 
 		 922 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  84.21 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  80.95 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  80.95 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 930 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  80.95 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 924 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09010  protein translocase subunit secA  56.67 
 
 		 920 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.665713  normal  0.0250229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4346  hypothetical protein  68 
 
 		 58 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  80.95 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 917 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  80.95 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  29.13 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  76.19 
 
 		 930 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  76.19 
 
 		 155 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  44.44 
 
 		 908 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  68.18 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  33.05 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  29.9 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  62.07 
 
 		 267 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  29.9 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  29.9 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  62.07 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  33.05 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 936 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  29.9 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  29.9 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  29.9 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  29.9 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  33.05 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 278 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  33.05 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  29.9 
 
 		 901 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>