More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0804 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0804  YecA  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  60.93 
 
 		 274 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  62.5 
 
 		 272 aa  333  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  61.81 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  61.48 
 
 		 278 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  57.79 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  57.79 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  58.58 
 
 		 281 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  52.71 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  36.09 
 
 		 222 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  33.19 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  27.76 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  27.76 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  25.28 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  29.43 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  28.84 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  27.9 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  27.43 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  26.72 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  27.34 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  26.69 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  27.34 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  26.95 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  26.95 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  26.95 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  26.95 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  26.95 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  26.95 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 837 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  74.19 
 
 		 897 aa  58.9  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  27.48 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  82.14 
 
 		 834 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  69.7 
 
 		 864 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  26.07 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  71.88 
 
 		 848 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  75.76 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  29.14 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 1031 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  26.13 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 858 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  74.19 
 
 		 1029 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  52.27 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 845 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  88 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  26.95 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  84 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  25 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 921 aa  56.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 944 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 836 aa  56.2  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  70.59 
 
 		 962 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  86.96 
 
 		 844 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  25.58 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  70.59 
 
 		 962 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  62.86 
 
 		 922 aa  55.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  70.59 
 
 		 962 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  74.19 
 
 		 1067 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  76 
 
 		 881 aa  55.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 838 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  76.92 
 
 		 923 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 866 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  25.19 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  36.96 
 
 		 156 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  25.65 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  25.19 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 921 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  24.81 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  25.19 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 872 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 888 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  59.52 
 
 		 1102 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  51.16 
 
 		 958 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  39.33 
 
 		 164 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  61.54 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  52.27 
 
 		 535 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 833 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  79.17 
 
 		 910 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  80 
 
 		 593 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  39.09 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1118 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  68.57 
 
 		 135 aa  52.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  84 
 
 		 170 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  76.67 
 
 		 162 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 933 aa  52.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  95 
 
 		 228 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  68.97 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  59.52 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 859 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  39.77 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 957 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  94.74 
 
 		 1200 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 936 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  75 
 
 		 918 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 618 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  59.46 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  75 
 
 		 110 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  61.29 
 
 		 894 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  73.08 
 
 		 830 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>