More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4502 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  29.91 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  27.72 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3156  SecC motif-containing protein  26.01 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  76.67 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  76.67 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  76.67 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  76.67 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  76.67 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  76.67 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  76.67 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  76.67 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  76.67 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  26.81 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  26.81 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  78.57 
 
 		 1029 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  70 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  73.33 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 896 aa  56.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  65.52 
 
 		 845 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 897 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 1031 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  35.71 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1266  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 1022 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  68.97 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  68.97 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  36.78 
 
 		 900 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  64.29 
 
 		 848 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  37.18 
 
 		 432 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2780  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  36.36 
 
 		 916 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1311  preprotein translocase subunit SecA  74.07 
 
 		 1024 aa  52.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  86.36 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 731 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  39.68 
 
 		 170 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 731 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  71.43 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  51.22 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  64.29 
 
 		 1136 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 1102 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  58.62 
 
 		 837 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  68.97 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  38.55 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  65.52 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 1200 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  44.64 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  44.64 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 834 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  90 
 
 		 104 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  44.64 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  44.64 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 1017 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  56.67 
 
 		 881 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  55.81 
 
 		 945 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  44.64 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  44.64 
 
 		 152 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 844 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  44.64 
 
 		 152 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 872 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1146  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 1277 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  44.26 
 
 		 1024 aa  50.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  76 
 
 		 535 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  44.64 
 
 		 159 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  44.64 
 
 		 159 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  53.85 
 
 		 958 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 921 aa  50.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 864 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  94.44 
 
 		 888 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 858 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  81.82 
 
 		 150 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  94.44 
 
 		 866 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  73.08 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 836 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  70.37 
 
 		 904 aa  49.3  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 		 910 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  54.29 
 
 		 838 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  38.55 
 
 		 161 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  80.95 
 
 		 420 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  80 
 
 		 225 aa  49.3  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 908 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  64.52 
 
 		 110 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 894 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 911 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  85 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 908 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 908 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  77.27 
 
 		 168 aa  48.9  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 1118 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>