More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2445 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  46.27 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  35.4 
 
 		 896 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  33.93 
 
 		 836 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  35.04 
 
 		 910 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  82.14 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  81.48 
 
 		 844 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 864 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 912 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 944 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 838 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 913 aa  56.2  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 896 aa  56.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 888 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 916 aa  56.2  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  67.74 
 
 		 921 aa  55.8  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  76.92 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 962 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  74.07 
 
 		 962 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  78.57 
 
 		 170 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 858 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  70.37 
 
 		 61 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 962 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1588  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000121054  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 922 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 842 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0646  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 881 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  51.06 
 
 		 897 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 917 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 917 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  63.89 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 833 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 872 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  66.67 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  66.67 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  67.74 
 
 		 236 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 908 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  43.33 
 
 		 897 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 834 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 908 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 911 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 907 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  48.15 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  67.86 
 
 		 848 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 912 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 908 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  62.5 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 908 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  44.64 
 
 		 896 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  62.5 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  60.53 
 
 		 162 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 909 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 866 aa  53.5  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  62.5 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 908 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 908 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  73.08 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  62.5 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 921 aa  53.5  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 908 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 859 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 907 aa  53.1  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 916 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 914 aa  52.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  76 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  79.17 
 
 		 378 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  62.96 
 
 		 906 aa  52.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 903 aa  52.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  83.33 
 
 		 162 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 909 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  67.86 
 
 		 914 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 907 aa  52.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  66.67 
 
 		 909 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 910 aa  52.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  67.74 
 
 		 899 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2351  hypothetical protein  80.77 
 
 		 66 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 939 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  69.23 
 
 		 903 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 907 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 1067 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  31.3 
 
 		 894 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  47.27 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 908 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  47.27 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  74.07 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  42.19 
 
 		 910 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  46.81 
 
 		 1113 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 896 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4502  hypothetical protein  65.52 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000195351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 915 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 1118 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  40.26 
 
 		 916 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  36.71 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>