259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3412 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3412  ATPase  100 
 
 		 110 aa  232  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  54.55 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  52.78 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  53.7 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1393  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.283101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2927  SecC motif-containing protein  49.07 
 
 		 112 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0708  SecC motif-containing protein  50.91 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  47.22 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3385  SecC motif-containing protein  47.22 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  47.22 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1069  SEC-C motif domain protein  47.22 
 
 		 112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000283435  normal  0.0133349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  46.36 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3331  SecC motif-containing protein  46.3 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  46.3 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  46.3 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2967  SecC motif-containing protein  42.34 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1292  SecC motif-containing protein  44.21 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.166274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  32.43 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  75 
 
 		 272 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 1029 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 1031 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  95 
 
 		 420 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  75 
 
 		 283 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 276 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  71.43 
 
 		 276 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  74.19 
 
 		 888 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  62.86 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 278 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1206  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 1027 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.944412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  75 
 
 		 260 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 912 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  70.37 
 
 		 432 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  41.18 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  77.78 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 848 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  90 
 
 		 259 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0418  hypothetical protein  85.71 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0335535  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 855 aa  47.4  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 897 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  61.29 
 
 		 845 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 906 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  77.27 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  94.44 
 
 		 834 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 864 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 896 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3880  hypothetical protein  39.74 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0869026  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 535 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  44 
 
 		 907 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 958 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 384 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  81.82 
 
 		 866 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  94.44 
 
 		 593 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  50 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  36.9 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  35.24 
 
 		 835 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  78.26 
 
 		 896 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1018  preprotein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 1017 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00760005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 957 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  35.53 
 
 		 235 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  64.29 
 
 		 314 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  36.54 
 
 		 836 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1635  hypothetical protein  52.63 
 
 		 429 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.223926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  88.89 
 
 		 837 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  56.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  56.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  36.71 
 
 		 962 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  56.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  35.24 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  35.24 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  35.24 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 910 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  35.24 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  36.71 
 
 		 962 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  35.24 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 274 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  35.24 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  35.24 
 
 		 835 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  56.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  56.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  56.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  31.9 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  56.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 836 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  56.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  56.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  36.71 
 
 		 962 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  71.43 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 858 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  88.89 
 
 		 800 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  45.83 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  35.24 
 
 		 835 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 838 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  61.29 
 
 		 264 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  84.21 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  94.44 
 
 		 253 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  30.56 
 
 		 894 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  85 
 
 		 319 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  80 
 
 		 231 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  84.21 
 
 		 844 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  88.89 
 
 		 921 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>