More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3153 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 160 aa  337  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  64.38 
 
 		 160 aa  236  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  61.59 
 
 		 164 aa  214  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  60.37 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  63.4 
 
 		 160 aa  209  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  60 
 
 		 160 aa  210  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  56.96 
 
 		 161 aa  206  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  58.49 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  46.84 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  48.78 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  48.73 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  46.5 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  44.44 
 
 		 162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  45.22 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  44.37 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  42.31 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  43.23 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  41.25 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  41.25 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  40.62 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  41.14 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  42.68 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  42.04 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  42.04 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  40.13 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  38.61 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  42.24 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  37.97 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  41.61 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  42.58 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  43.48 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  41.94 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  40.51 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  36.59 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  42.97 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  39.62 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  37.13 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  41.86 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  40.12 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  43.31 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  42.75 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  41.77 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  39.13 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  42.75 
 
 		 129 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  38.22 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  38.61 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  38.22 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  38.85 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  40.13 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  38.85 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  38.22 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  38.85 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  38.75 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  38.85 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  42.19 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  38.85 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  37.74 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  37.74 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  37.74 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  40.88 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  33.15 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  37.8 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  34.34 
 
 		 191 aa  103  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  36.59 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2387  hypothetical protein  33.86 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.561685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  41.27 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  35.8 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  37.65 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  36.63 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  35 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  40.94 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  36.36 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  36.63 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  35.67 
 
 		 152 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  40.32 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  40.48 
 
 		 128 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  40.48 
 
 		 128 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  35.98 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  36.36 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  34.97 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  35.26 
 
 		 175 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  35.26 
 
 		 175 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  38.71 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  35.26 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  34.18 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  35.44 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  42.4 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  31.29 
 
 		 177 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  37.42 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  41.27 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  36.42 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  37.88 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  41.6 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  37.98 
 
 		 129 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>