168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4551 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  100 
 
 		 131 aa  277  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  65.62 
 
 		 128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  66.14 
 
 		 128 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  63.57 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  44.53 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  44.19 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  44.19 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  41.22 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  42.19 
 
 		 160 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  41.54 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  39.84 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  39.06 
 
 		 160 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  42.19 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  40.32 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  39.06 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  38.28 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  40.94 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  43.2 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  40.62 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  43.09 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  43.09 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  42.19 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  40.31 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  42.62 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  40.65 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  41.8 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  40.98 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  36.22 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  39.84 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  39.84 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  35.2 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  38.66 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  40.65 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  37.7 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  40.98 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  33.08 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  36.22 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  39.34 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  35.77 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  34.96 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1547  ribosomal protein L20  35.38 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  33.11 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  34.13 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  33.11 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  32.45 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  39.2 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  36.84 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  36 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  31.75 
 
 		 158 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  34.13 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  34.11 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  36.15 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  34.13 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  35.16 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  35.25 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  36.52 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  35.25 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  38.58 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  31.79 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  31.79 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  34.68 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  38.58 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  31.65 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  37.8 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  35.16 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  37.98 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  37.98 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  36.15 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  32.26 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  34.62 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  30.15 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  31.2 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  31.2 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  31.2 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  37.93 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  35.71 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  36.07 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  35.83 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  33.81 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  37.9 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  37.4 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  37.17 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  32.8 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  33.08 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  37.29 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  36.22 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  34.68 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  31.54 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  34.68 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  34.68 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  36.22 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  34.68 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  34.11 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  34.38 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  32 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  34.13 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  34.68 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  33.59 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  33.86 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  34.15 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>