More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4297 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  329  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  96.84 
 
 		 158 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  95.51 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  91.77 
 
 		 160 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  82.28 
 
 		 158 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  78.21 
 
 		 157 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  76.92 
 
 		 157 aa  260  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  77.78 
 
 		 160 aa  251  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  69.87 
 
 		 157 aa  230  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  69.23 
 
 		 160 aa  226  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  71.43 
 
 		 160 aa  221  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  43.48 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  42.31 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  44.51 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  41.25 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  42.04 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  48.03 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  47.37 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  40.99 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  38.46 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  44.97 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  38.75 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  39.38 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  39.38 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  42.41 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2387  hypothetical protein  36.56 
 
 		 187 aa  118  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.561685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  44.97 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  40.99 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  44.3 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  41.67 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  43.24 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  44.3 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  39.74 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  44.3 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  41.72 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  45.33 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  40.25 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  44.97 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  44.97 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  37.2 
 
 		 169 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  46.45 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  41.72 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  46.41 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  44.08 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  40.25 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  40.67 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  34.18 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  34.18 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  43.42 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  43.42 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  42.38 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  42.59 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  42.76 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  41.06 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  45.93 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  36.25 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  40.38 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  34.57 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  44.19 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  38.31 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  45.24 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  44.19 
 
 		 128 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  37.95 
 
 		 175 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  37.95 
 
 		 175 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  37.82 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  36 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  38.51 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  37.35 
 
 		 175 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  39.22 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01838  hypothetical protein  45.31 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  45.9 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  34.57 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  36.75 
 
 		 175 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  36.75 
 
 		 175 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  36.31 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  37.11 
 
 		 163 aa  87.4  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  38.12 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  39.69 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  36.92 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  38.61 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  43.44 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  44.88 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  40.65 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  41.73 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  37.11 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  36.42 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  40.44 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  43.41 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  41.98 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  37.82 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  39.26 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  43.55 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.737091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>