168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2291 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  100 
 
 
191 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2387  hypothetical protein  52.04 
 
 
187 aa  204  8e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.561685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  52.55 
 
 
183 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  43.75 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  42.5 
 
 
157 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  42.5 
 
 
160 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  43.67 
 
 
158 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  43.04 
 
 
160 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  42.14 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  41.51 
 
 
158 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  41.77 
 
 
157 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  41.77 
 
 
157 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  40.25 
 
 
158 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  36.53 
 
 
161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  32.95 
 
 
161 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  32.73 
 
 
160 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  36.31 
 
 
160 aa  104  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  34.34 
 
 
160 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  35.47 
 
 
164 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  34.88 
 
 
164 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  39.1 
 
 
160 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  34.71 
 
 
163 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  32.2 
 
 
167 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  35.85 
 
 
159 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  36.09 
 
 
162 aa  92  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  33.74 
 
 
158 aa  92  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  31.35 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  31.35 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  35.22 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  35.22 
 
 
152 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  35.22 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  35.85 
 
 
155 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  35.22 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  35.22 
 
 
152 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  35.22 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  35.67 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  36.75 
 
 
158 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  37.74 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  31.35 
 
 
154 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  35.22 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  35.22 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  35.67 
 
 
168 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  35.67 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  35.67 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  35.67 
 
 
168 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  31.76 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  32.78 
 
 
161 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  31.61 
 
 
154 aa  85.5  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  35 
 
 
162 aa  85.1  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  33.92 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  33.54 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  31.55 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  32.53 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  33.96 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  31.45 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  35.8 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  33.76 
 
 
155 aa  82  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  32.34 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  29.84 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  29.41 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  30.25 
 
 
148 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  32.14 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  32.52 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  32.34 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  32.34 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  31.75 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  32.1 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  32.02 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  32.93 
 
 
165 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  30.81 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  33.13 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  38.35 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  34.81 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  37.04 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  35.4 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  33.52 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  33.52 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  29.3 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  37.31 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  35 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  32.95 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  33.81 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  32.95 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  32.95 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  30.59 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  31.34 
 
 
131 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  32.87 
 
 
142 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  31.95 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  32.35 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  33.33 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  30.34 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  28.12 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  37.17 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  31.95 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  40.54 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  41.67 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  35.62 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  38.06 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>