170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4932 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  254  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  61.16 
 
 
139 aa  154  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  64.17 
 
 
132 aa  146  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  58.54 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  62.71 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  58.68 
 
 
137 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  58.73 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  56.9 
 
 
191 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  59.66 
 
 
122 aa  133  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  54.84 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  55.46 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  54.84 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  56.56 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  57.14 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  53.78 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  52.94 
 
 
128 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  52.94 
 
 
128 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  54.7 
 
 
132 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  52.59 
 
 
141 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  52.85 
 
 
129 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  45 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  51.18 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  50.41 
 
 
121 aa  114  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  52.46 
 
 
138 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  51.67 
 
 
134 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  52.07 
 
 
129 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  51.59 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  48 
 
 
143 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  51.91 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  50.41 
 
 
129 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  51.15 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  50.42 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  47.15 
 
 
125 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  54.62 
 
 
140 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1396  SecC motif-containing protein  56.84 
 
 
108 aa  103  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0319965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  48.76 
 
 
150 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  47.41 
 
 
135 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  50.39 
 
 
143 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  40.91 
 
 
163 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  47.89 
 
 
148 aa  100  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  47.66 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  46.67 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  39.17 
 
 
126 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  45.26 
 
 
150 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  48.03 
 
 
137 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  45.08 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  45.31 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  46.4 
 
 
162 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  45.16 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  39.37 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  39.06 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  48.44 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  40 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  48.46 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  47.97 
 
 
144 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0098  hypothetical protein  45.99 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0577  hypothetical protein  45.99 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3083  hypothetical protein  45.99 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.457185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2012  hypothetical protein  45.99 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0415  hypothetical protein  45.99 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2275  hypothetical protein  45.99 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  44.26 
 
 
130 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  49.19 
 
 
136 aa  93.2  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  41.13 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  42.75 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  47.46 
 
 
142 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  41.94 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  43.08 
 
 
131 aa  92  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  51.56 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  39.37 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  38.71 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  37.59 
 
 
175 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  37.59 
 
 
175 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  37.1 
 
 
168 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  40.15 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  38.76 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  38.71 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  37.1 
 
 
168 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  37.1 
 
 
168 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0494  hypothetical protein  46.09 
 
 
150 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  36.88 
 
 
175 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  36.88 
 
 
175 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  35.46 
 
 
175 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  37.1 
 
 
168 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  42.64 
 
 
155 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  38.89 
 
 
163 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2841  hypothetical protein  43.07 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  36.29 
 
 
168 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  37.12 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  41.41 
 
 
161 aa  87.8  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  40.31 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2978  hypothetical protein  43.07 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  36 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  47.15 
 
 
138 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  36.43 
 
 
169 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  41.86 
 
 
155 aa  86.7  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  42.45 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2315  hypothetical protein  44.85 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2929  hypothetical protein  44.85 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.620501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>