169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3857 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  60.58 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  59.12 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  53.47 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  59.06 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  56.35 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  55.3 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  58.87 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  56.15 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  60.68 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  59.84 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  58.33 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  60.16 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2841  hypothetical protein  54.29 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2978  hypothetical protein  52.86 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  55.22 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  56.06 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6272  hypothetical protein  54.01 
 
 		 145 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  55.2 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0098  hypothetical protein  59.83 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0577  hypothetical protein  59.83 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  55.3 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3083  hypothetical protein  59.83 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.457185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2012  hypothetical protein  59.83 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0415  hypothetical protein  59.83 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2275  hypothetical protein  59.83 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0376  hypothetical protein  52.52 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.745389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  54.4 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2944  hypothetical protein  51.8 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  51.49 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  53.28 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2315  hypothetical protein  50.36 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2929  hypothetical protein  50.36 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.620501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  51.11 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0458  hypothetical protein  51.43 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  50.71 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  51.59 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  53.79 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  51.85 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  49.6 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  52.85 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  50.39 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  52.67 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  52 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  48.53 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  48.06 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  52.5 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  50.39 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  47.29 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  47.29 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  51.64 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  53.12 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  46.67 
 
 		 137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  43.31 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  48.76 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  106  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  41.73 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  50.81 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  51.18 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  37.98 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  52.89 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  50 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  44.97 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  46.46 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  41.27 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  43.65 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  43.65 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  43.65 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  43.31 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  43.65 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  44.62 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  43.65 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  42.64 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  43.65 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  43.65 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  46.97 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  45.45 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  46.92 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  44.62 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  40.8 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  44.8 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  44.53 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  43.08 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  40.77 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  45.8 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  41.35 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  38.64 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  44.92 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  39.46 
 
 		 175 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  39.46 
 
 		 175 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  38.89 
 
 		 175 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  38.89 
 
 		 175 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  41.8 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  41.35 
 
 		 166 aa  90.1  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  36.72 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  42.28 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>