169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0389 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  100 
 
 
131 aa  275  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  46.88 
 
 
162 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  43.31 
 
 
134 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  45.53 
 
 
127 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  41.09 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  42.06 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  43.55 
 
 
167 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  41.22 
 
 
155 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  42.31 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  40.46 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  43.09 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  46.34 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  41.54 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  41.86 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  41.86 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  45.8 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  41.86 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  41.86 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  41.86 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  40.62 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  41.86 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  41.86 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  38.76 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  39.06 
 
 
128 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  40.31 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  40.94 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  39.68 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  43.08 
 
 
125 aa  92  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  36.15 
 
 
168 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  39.53 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 
128 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 
128 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  36.15 
 
 
168 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  39.69 
 
 
139 aa  90.1  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  35.94 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  41.73 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  36.15 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  36.15 
 
 
168 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  39.37 
 
 
162 aa  88.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  41.46 
 
 
130 aa  88.6  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  41.35 
 
 
130 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  36.15 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  39.84 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  39.23 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  37.3 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  37.6 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  40.62 
 
 
165 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  38.1 
 
 
162 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  35.16 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  40.77 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  40.16 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  36.8 
 
 
164 aa  87  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  38.35 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1396  SecC motif-containing protein  47 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0319965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  36.92 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  39.53 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  40.16 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  38.1 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  40.46 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  36.64 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  37.69 
 
 
157 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  36.64 
 
 
160 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  38.17 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  42.06 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  39.68 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  34.65 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  38.1 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  36.15 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  36.15 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  41.94 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  38.84 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  38.1 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  39.68 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  36 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  38.4 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  37.69 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  37.69 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  39.2 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  39.68 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  35.48 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  36.15 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  38.89 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  37.12 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  37.6 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  38.35 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  36.22 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  41.86 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  36.36 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  39.39 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  38.64 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  41.8 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  37.32 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  38.52 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  36.92 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  34.4 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  36.15 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>