167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4338 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  264  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  45.04 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  37.98 
 
 
165 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  41.32 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  36.22 
 
 
163 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  36 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  39.84 
 
 
162 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  34.92 
 
 
160 aa  86.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  34.96 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  36.64 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  39.37 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  38.71 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  38.71 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  38.71 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  37.9 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  34.4 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  34.15 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  34.4 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  32 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  36.36 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  37.01 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  33.61 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  35.66 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  35.66 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  37.6 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  35.66 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  35.66 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  34.88 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1547  ribosomal protein L20  35.88 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  35.66 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  33.6 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  38.35 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  34.59 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  34.31 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  34.88 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  35.48 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  35.11 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  35.43 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  31.25 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  34.4 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  34.11 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  36.07 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  34.88 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  31.58 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  31.82 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  32.26 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  36.8 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  34.13 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  40.17 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  32.54 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  33.85 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  35.56 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  32 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  36 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  34.06 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  31.75 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  36 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  36.07 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  32.03 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  31.5 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  32.28 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  36.97 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  38.58 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  34.11 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  33.08 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  30.23 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  34.11 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  34.11 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  33.6 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  33.87 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  38.33 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  32.82 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  34.13 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0458  hypothetical protein  36.21 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  31.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  31.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  31.5 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  31.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  36.21 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  31.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  31.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  31.3 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  31.5 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  31.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  31.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  30.4 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  33.07 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  33.07 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  33.07 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  33.07 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  32.56 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  32.31 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  33.06 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2387  hypothetical protein  32.14 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.561685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  30.33 
 
 
191 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  32.26 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  35.11 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>