165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1547 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1547  ribosomal protein L20  100 
 
 		 134 aa  281  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  45.38 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  43.48 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  40.6 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  41.04 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  40.44 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  38.81 
 
 		 155 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  42.31 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  38.06 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  40.46 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  36.09 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  36.96 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  38.52 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  36.76 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  39.85 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  42.75 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  39.26 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  41.79 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  39.1 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  34.85 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  37.59 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  37.59 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  37.59 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  37.59 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  37.59 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  37.59 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  37.59 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  37.59 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  34.56 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  34.56 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  37.59 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  39.39 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  37.96 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  40.3 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  41.54 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  36.36 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  38.24 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  35.77 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  35.38 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  40.77 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  35.88 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  36.96 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  37.96 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  38.46 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  37.96 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  38.41 
 
 		 162 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  33.83 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  39.23 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  35.82 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  38.06 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  31.54 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  33.59 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  35.82 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  40.58 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  36.57 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  36.3 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  36.23 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  37.12 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  36.23 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  37.24 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  37.24 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  38.51 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  38.76 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  38.76 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  35.82 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  41.13 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  37.23 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  38.13 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  36.5 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  38.69 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  35.51 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  35.56 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  37.04 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  35.61 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  36.5 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  33.58 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  32.84 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  34.31 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  36.23 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  32.59 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  39.84 
 
 		 191 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  35.82 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  36.55 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  38.97 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  35.82 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  34.09 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  38.69 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  35.07 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  36.84 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  32.33 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  34.33 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>