169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2103 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  100 
 
 
128 aa  261  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  100 
 
 
128 aa  261  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  98.44 
 
 
128 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  66.14 
 
 
125 aa  167  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  65.35 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  49.59 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  53.08 
 
 
121 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  54.1 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  52.94 
 
 
125 aa  124  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  52.07 
 
 
132 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  53.33 
 
 
147 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  52.54 
 
 
139 aa  123  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  53.23 
 
 
130 aa  122  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  48.78 
 
 
132 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  47.66 
 
 
139 aa  120  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  54.1 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  50.77 
 
 
134 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  45.38 
 
 
130 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  46.22 
 
 
137 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  50 
 
 
150 aa  116  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  50 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  52.54 
 
 
122 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  48.06 
 
 
129 aa  113  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  48 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  49.58 
 
 
127 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  47.29 
 
 
129 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  45.9 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  41.13 
 
 
126 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  45.31 
 
 
141 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  48.76 
 
 
135 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  47.01 
 
 
141 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  44.53 
 
 
143 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  42.19 
 
 
162 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1396  SecC motif-containing protein  55.21 
 
 
108 aa  104  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0319965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  45.31 
 
 
143 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  40.48 
 
 
164 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  39.68 
 
 
164 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  47.06 
 
 
191 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  43.55 
 
 
160 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  46.09 
 
 
137 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  39.68 
 
 
160 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  44.44 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  40.48 
 
 
160 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  40.44 
 
 
136 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  44.44 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  43.75 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  41.41 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  45.53 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  45.11 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  44.72 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.347573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  39.52 
 
 
152 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  39.52 
 
 
152 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  44.88 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  39.52 
 
 
159 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  37.01 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  39.52 
 
 
152 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  46.77 
 
 
136 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  39.52 
 
 
159 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  39.52 
 
 
152 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  39.52 
 
 
152 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  37.6 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  39.52 
 
 
152 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  39.52 
 
 
152 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  42.31 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  37.01 
 
 
168 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  37.01 
 
 
168 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  37.01 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  35.2 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  40.94 
 
 
163 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  36.22 
 
 
168 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  37.5 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  41.98 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  38.17 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  42.4 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  41.73 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  42.4 
 
 
133 aa  87  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  42.34 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  36 
 
 
163 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  43.22 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  37.4 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  36.89 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  33.59 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  39.73 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  32.06 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  40.3 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  38.81 
 
 
155 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  42.22 
 
 
148 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  33.06 
 
 
158 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  42.64 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  38.93 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  36.22 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  35.48 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  36.36 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  33.6 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  39.68 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  39.46 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  33.09 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>