168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  290  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  59.85 
 
 
130 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  56.35 
 
 
132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  51.97 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  53.6 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  57.85 
 
 
132 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  48.95 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  54.03 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  50.39 
 
 
134 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  48.06 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  52.71 
 
 
127 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  47.66 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  48.09 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  48 
 
 
125 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  51.22 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  47.54 
 
 
147 aa  107  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  46.09 
 
 
128 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  45.31 
 
 
128 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  45.31 
 
 
128 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  45.16 
 
 
158 aa  103  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  45.24 
 
 
125 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  43.85 
 
 
155 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  41.35 
 
 
161 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  44.62 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  45.31 
 
 
138 aa  97.1  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  43.45 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  42.62 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  44.8 
 
 
129 aa  94.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  40 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  47.45 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  45.9 
 
 
191 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  46.09 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  37.88 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  40.94 
 
 
168 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  40.94 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  40.94 
 
 
168 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  39.37 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  39.53 
 
 
161 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  40.94 
 
 
168 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  40.94 
 
 
168 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  39.68 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  32.84 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  42.06 
 
 
162 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  45.24 
 
 
162 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  40.77 
 
 
165 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  33.87 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  37.12 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  39.53 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  43.61 
 
 
142 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  37.4 
 
 
162 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  38.58 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  38.58 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  38.58 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  38.58 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  38.58 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  38.58 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  38.58 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  38.58 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  41.91 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  44 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  34.96 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  41.04 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  36.15 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  40.46 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  40.8 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  40 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  41.54 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  39.06 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1396  SecC motif-containing protein  48.48 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0319965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  35.34 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0494  hypothetical protein  42.42 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  36.64 
 
 
158 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  35.48 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  39.55 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  36.43 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  34.33 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  36.62 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  41.41 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  33.08 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  35.43 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  31.45 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  32.84 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  35.11 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  36.15 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  40.62 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  37.69 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  43.28 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  35.43 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  35.94 
 
 
148 aa  77  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  39.2 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  35.43 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  41.22 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  39.23 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  34.59 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  40.6 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  37.23 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  31.3 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  36.15 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>