167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0494 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0494  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  308  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  65.93 
 
 
142 aa  189  9e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  47.33 
 
 
127 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  48.48 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  47.33 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  48 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  45.04 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  40.91 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  45.74 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  43.38 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  42.02 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  49.22 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  43.2 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  40.16 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  37.88 
 
 
160 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  43.94 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  41.91 
 
 
146 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  38.58 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  40.71 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  41.09 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  42.31 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  42.96 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  43.08 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  42.42 
 
 
165 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  43.31 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  38.58 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  41.35 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  37.8 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  38.98 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  43.31 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  37.32 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  40.74 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  40.77 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  40 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  37.8 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  43.43 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  40 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  41.6 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  38.93 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  35.82 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  43.31 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  37.1 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  39.53 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  39.23 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  39.23 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  41.09 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  38.58 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  42.57 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  37.59 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  36.64 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  37.31 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  35.56 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  38.06 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  41.04 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  36.72 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  37.98 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  41.22 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  35.88 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  43.18 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  42.97 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  36.92 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  34.59 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  40.6 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  35.82 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  35.66 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  37.4 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  35.71 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  36.96 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  35.97 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  33.82 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  39.23 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  36.15 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  36.15 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  36.15 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  36.15 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  36.15 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  36.15 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  36.15 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  36.15 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  37.41 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  34.33 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  66.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  35.97 
 
 
164 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  36.64 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  35.82 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  33.81 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  37.8 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  34.87 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  34.87 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  35.82 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  36.64 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  35.82 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  36.64 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  36.96 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  36.92 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  33.6 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  40 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  34.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  34.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>