170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0058 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  100 
 
 
132 aa  266  8.999999999999999e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  62.02 
 
 
130 aa  148  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  64.17 
 
 
125 aa  146  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  56.56 
 
 
132 aa  135  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  55.74 
 
 
135 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  55.37 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  57.26 
 
 
139 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  56.35 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  58.47 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  53.72 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  56.67 
 
 
139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  58.97 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  56.41 
 
 
147 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  52.07 
 
 
128 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  52.07 
 
 
128 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  52 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  55.37 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  49.21 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  54.92 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  53.6 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  47.15 
 
 
135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  41.13 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  49.14 
 
 
191 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  51.72 
 
 
141 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  53.78 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  50 
 
 
129 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  50.81 
 
 
129 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  52.07 
 
 
146 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  50.35 
 
 
148 aa  100  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  36.8 
 
 
126 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  53.1 
 
 
146 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  47.54 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  43.65 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  49.59 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  44.35 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  41.86 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  38.76 
 
 
161 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  38.28 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  42.98 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  48.36 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  46.09 
 
 
162 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  42.64 
 
 
133 aa  87  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  43.75 
 
 
162 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  38.4 
 
 
169 aa  85.9  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  45.45 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  43.55 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  43.31 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0494  hypothetical protein  47.66 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  41.27 
 
 
138 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  45.74 
 
 
132 aa  84  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  43.41 
 
 
165 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  32.28 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  40.94 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  43.44 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  45.83 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  38.1 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1396  SecC motif-containing protein  48.42 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0319965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  37.9 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  37.9 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  37.9 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  37.9 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  38.69 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  37.9 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  39.68 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  41.48 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  30.65 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  40.15 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  35.56 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  35.71 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  34.4 
 
 
167 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  40.65 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  35.71 
 
 
158 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  31.06 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  37.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  37.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  37.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  37.01 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  37.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  37.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  37.1 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  32.82 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  36.8 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  37.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  37.1 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  35.48 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  42.74 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  37.1 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  33.6 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  33.85 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  33.6 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  39.02 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  31.25 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  42.97 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  37.6 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  41.98 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0098  hypothetical protein  41.53 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65864  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  37.41 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  40.65 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  37.8 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>