More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1573 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  352  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  99.4 
 
 
168 aa  351  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  99.4 
 
 
168 aa  350  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  99.4 
 
 
168 aa  350  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  99.4 
 
 
168 aa  349  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  79.87 
 
 
159 aa  270  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  80.26 
 
 
152 aa  267  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  80.26 
 
 
152 aa  267  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  80.26 
 
 
152 aa  267  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  80.26 
 
 
152 aa  267  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  80.26 
 
 
152 aa  267  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  78.57 
 
 
159 aa  267  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  79.61 
 
 
152 aa  267  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  79.61 
 
 
152 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  71.05 
 
 
152 aa  237  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  52.6 
 
 
154 aa  170  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  52.6 
 
 
154 aa  170  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  52.6 
 
 
154 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  52 
 
 
154 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  49.68 
 
 
155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  45.16 
 
 
155 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  44.05 
 
 
167 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  45.81 
 
 
155 aa  140  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  44 
 
 
151 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  45.51 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  41.14 
 
 
175 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  41.14 
 
 
175 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  40.57 
 
 
175 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  42.04 
 
 
160 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  41.36 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  43.95 
 
 
166 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  37.42 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  43.92 
 
 
160 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  39.88 
 
 
175 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  39.88 
 
 
175 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  38.99 
 
 
162 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  42.5 
 
 
164 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  42.48 
 
 
158 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  41.18 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  41.36 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  44.3 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  40.13 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  41.51 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  42.41 
 
 
157 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  38.04 
 
 
164 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  43.42 
 
 
150 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  38.96 
 
 
159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  38.96 
 
 
159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  45.97 
 
 
130 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  41.18 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  37.34 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  37.97 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  42.95 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  42.52 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  42.95 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  42.86 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  44.81 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  38.85 
 
 
160 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  42.64 
 
 
129 aa  111  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  39.13 
 
 
169 aa  111  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  38.12 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  40.91 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  40.54 
 
 
160 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  41.22 
 
 
158 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  39.62 
 
 
162 aa  107  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  42.52 
 
 
129 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  42.06 
 
 
127 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  42.75 
 
 
141 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  40.38 
 
 
163 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  40.65 
 
 
159 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01838  hypothetical protein  43.65 
 
 
137 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  36.88 
 
 
161 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  43.75 
 
 
138 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  35.4 
 
 
161 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  40.76 
 
 
159 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  34.34 
 
 
170 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  40.77 
 
 
138 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  37.65 
 
 
158 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  37.04 
 
 
165 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  41.13 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  41.98 
 
 
143 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  39.07 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  40.32 
 
 
136 aa  97.4  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  41.41 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  38.13 
 
 
136 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  37.91 
 
 
148 aa  95.1  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  41.41 
 
 
125 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  37.8 
 
 
128 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  41.86 
 
 
130 aa  94  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  33.77 
 
 
158 aa  94  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  37.32 
 
 
139 aa  94  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  37.01 
 
 
161 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  37.01 
 
 
146 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  37.58 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  37.42 
 
 
165 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  37.68 
 
 
143 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  36.36 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>