More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1977 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  328  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  92.26 
 
 		 155 aa  308  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  63.87 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  63.23 
 
 		 155 aa  197  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  55.48 
 
 		 154 aa  191  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  54.19 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  54.19 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  54.19 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  50.97 
 
 		 152 aa  168  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  48.39 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  48.39 
 
 		 152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  48.39 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  48.39 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  48.39 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  48.39 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  48.39 
 
 		 152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  47.74 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  47.74 
 
 		 159 aa  159  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  45.16 
 
 		 168 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  45.16 
 
 		 168 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  45.16 
 
 		 168 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  44.52 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  44.52 
 
 		 168 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  40.94 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  44.17 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  43.56 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  42.24 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  48.03 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  43.95 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  41.25 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  40.85 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  43.48 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  43.48 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  47.37 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  47.37 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  46.05 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  42.41 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  44.74 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  42.07 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  41.61 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  37.35 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  41.56 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  37.5 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  37.2 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  37.95 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  38.27 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  41.67 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  38.46 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  40 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  38.31 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  42.58 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  42.59 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  38.22 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  38.99 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  38.22 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  38.46 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  39.49 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  38.41 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  41.94 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  37.72 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  43.28 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  33.74 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  37.42 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  37.75 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  37.65 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  37.65 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  37.42 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  44.62 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  37.65 
 
 		 175 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  44.19 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  38.75 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  38.85 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  40.26 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  37.06 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  37.06 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  43.41 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  36.02 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  38.61 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  44.62 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  42.31 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  35.19 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  36.81 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  41.86 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  39.87 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  42.19 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  35.26 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  39.84 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  34.34 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  37.58 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  40.31 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  38.97 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  42.64 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  37.8 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  42.52 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  41.94 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  40.16 
 
 		 131 aa  87.4  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  38.17 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>