More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1315 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 165 aa  343  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  53.12 
 
 		 161 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  53.16 
 
 		 161 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  51.23 
 
 		 163 aa  167  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  50.62 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  48.72 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  48.73 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  50.94 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  48.78 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  46.88 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  45.96 
 
 		 164 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  43.04 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  45.28 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  45.95 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0490  SecC motif-containing protein  47.24 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  45.16 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  42.68 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  42.68 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  42.41 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  44.79 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  40.62 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  41.4 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  43.03 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  41.4 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  41.61 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  39.35 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  40.99 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  39.35 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  40.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  40.13 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  42.58 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  41.67 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  38.92 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  39.49 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  40.91 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  41.14 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  42.04 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  41.29 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  41.29 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  41.29 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  40.51 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  41.29 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  41.29 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  41.29 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  41.29 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  38.51 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  37.42 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  43.4 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  41.14 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  38.61 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  37.42 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2091  hypothetical protein  41.6 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  35.5 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  39.61 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  47.76 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  46.56 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  39.49 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  39.49 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  37.04 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  37.58 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  39.76 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  38.85 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  38.75 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  37.04 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  37.04 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  46.34 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  37.04 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  37.04 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  42.58 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  49.6 
 
 		 126 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2291  SecC motif-containing protein  31.76 
 
 		 191 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  38.51 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  31.22 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  33.54 
 
 		 163 aa  98.2  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  43.55 
 
 		 127 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  45.9 
 
 		 132 aa  95.5  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  38.89 
 
 		 129 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0419991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  33.95 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  42.11 
 
 		 129 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  39.2 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  34.38 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  43.08 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  41.04 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  39.61 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4338  hypothetical protein  37.6 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  35 
 
 		 164 aa  90.9  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4551  SecC-like protein  36.22 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  46.4 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  37.8 
 
 		 135 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  42.74 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  34.97 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  38.67 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  37.6 
 
 		 128 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  43.2 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  40.62 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  36.8 
 
 		 128 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  38.81 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  33.73 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  38.46 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>