170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1936 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  277  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  52.38 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  48.8 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  46.83 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  45.67 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  45.67 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  45.67 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  45.67 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  45.67 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  45.67 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  45.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  45.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  45.67 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  43.55 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  42.52 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  41.54 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01838  hypothetical protein  53.19 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  42.64 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  42.64 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  42.64 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  39.23 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0389  SecC motif-containing protein  41.09 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0161719  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  39.84 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  38.93 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  36.8 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  40.62 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  37.4 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  34.62 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  39.85 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  36.64 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  36.43 
 
 		 127 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  39.68 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  37.3 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  43.75 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  41.35 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  39.55 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  38.52 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  32.84 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  36.43 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  36.76 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  32.82 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  37.01 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  32.82 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  35.29 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  39.69 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  35.88 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  34.35 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  35.2 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  32.82 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  35.61 
 
 		 163 aa  87  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  36.51 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  36.22 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  36.43 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  37.3 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  37.01 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  34.88 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  32.06 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  31.3 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  32.06 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  36.36 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  36.22 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  35.71 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  34.68 
 
 		 139 aa  83.6  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  34.38 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  32.28 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  37.31 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  34.03 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  34.03 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  36.51 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  32.54 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  36.51 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  34.68 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  37.4 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  34.65 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3168  SecC motif-containing protein  36.43 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  34.92 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  36.51 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  34.92 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  37.14 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  30.89 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  33.81 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  36.8 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  31.3 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  32.12 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  29.55 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  35.2 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  30.3 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  32.12 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>