193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2167 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2122  SecC motif-containing protein  100 
 
 
175 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.70937  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2167  SecC motif-containing protein  100 
 
 
175 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.226363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2262  SEC-C motif domain protein  94.86 
 
 
175 aa  355  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0200175 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4535  hypothetical protein  94.29 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2249  SecC motif-containing protein  94.29 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2054  SecC motif-containing protein  65.7 
 
 
164 aa  248  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134044  normal  0.507231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2159  SecC motif-containing protein  65.12 
 
 
164 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0117714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1921  SecC motif-containing protein  65.09 
 
 
164 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0182958  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2497  hypothetical protein  64.91 
 
 
164 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1859  SecC motif-containing protein  64.37 
 
 
163 aa  231  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2119  metal-binding protein  51.5 
 
 
158 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0856883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2343  SecC motif-containing protein  51.18 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1884  SecC motif-containing protein  50 
 
 
163 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2054  SecC motif-containing protein  47.95 
 
 
161 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00181224  normal  0.116167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1820  metal-binding protein  47.9 
 
 
153 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.581548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2056  SecC motif-containing protein  47.19 
 
 
159 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2546  SecC motif-containing protein  45.14 
 
 
160 aa  147  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.117473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  43.45 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  41.71 
 
 
168 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  41.14 
 
 
168 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  41.14 
 
 
168 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  38.18 
 
 
151 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  44.31 
 
 
152 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  43.27 
 
 
159 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  41.14 
 
 
168 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  44.31 
 
 
152 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  44.31 
 
 
152 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  44.31 
 
 
152 aa  121  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  44.31 
 
 
152 aa  121  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  44.31 
 
 
152 aa  121  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  44.31 
 
 
152 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  40.57 
 
 
168 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  42.69 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1103  SecC motif-containing protein  40.46 
 
 
158 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  35.2 
 
 
167 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  36.87 
 
 
166 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  40.12 
 
 
152 aa  101  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  33.91 
 
 
156 aa  101  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2011  SecC motif-containing protein  36.69 
 
 
158 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  34.3 
 
 
160 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  36.63 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  33.71 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  37.65 
 
 
155 aa  99  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1218  hypothetical protein  41.57 
 
 
158 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  36.78 
 
 
155 aa  97.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2712  hypothetical protein  39.77 
 
 
154 aa  97.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  35.47 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19400  hypothetical protein  36.93 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2998  SEC-C motif domain protein  33.72 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0190811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  38.51 
 
 
162 aa  95.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  33.71 
 
 
164 aa  95.5  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1140  hypothetical protein  38.92 
 
 
160 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  38.97 
 
 
137 aa  94.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1961  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  94.4  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2333  hypothetical protein  38.32 
 
 
154 aa  94  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000246853  normal  0.0686575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  37.95 
 
 
158 aa  94  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2079  hypothetical protein  38.32 
 
 
154 aa  94  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.242107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  33.14 
 
 
162 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50900  hypothetical protein  40.59 
 
 
157 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  37.35 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  33.53 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  37.35 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3863  hypothetical protein  39.64 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  41.73 
 
 
138 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1970  hypothetical protein  37.72 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0903607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  33.71 
 
 
158 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  32.18 
 
 
161 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1420  hypothetical protein  37.08 
 
 
160 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  39.46 
 
 
129 aa  90.9  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  34.09 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  33.71 
 
 
169 aa  91.3  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1860  hypothetical protein  35.47 
 
 
159 aa  90.9  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  37.59 
 
 
125 aa  90.9  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1865  hypothetical protein  35.47 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2064  hypothetical protein  33.67 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  38.85 
 
 
147 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  35.63 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  38.3 
 
 
127 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  36.55 
 
 
132 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4340  hypothetical protein  36.78 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1160  SecC motif-containing protein  31.95 
 
 
148 aa  88.2  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  31.79 
 
 
163 aa  88.2  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  38.24 
 
 
139 aa  87.8  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3524  SEC-C motif domain protein  38.62 
 
 
128 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4127  SEC-C motif domain protein  37.28 
 
 
157 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1865  hypothetical protein  35.63 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.497309  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1936  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  84.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  33.81 
 
 
128 aa  84.7  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  36.88 
 
 
141 aa  84.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3024  SEC-C protein  36.81 
 
 
128 aa  84.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.371344  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  38.13 
 
 
129 aa  84.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01065  SEC-C motif domain protein  34.46 
 
 
177 aa  84.3  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  35.97 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  36.81 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  36.3 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2387  hypothetical protein  31.31 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.561685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  33.09 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  33.09 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2883  hypothetical protein  31.29 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000097647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2428  sec-C-like protein  38.73 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0419991 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>